Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXA6

Cldn17, Claudin-17, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn17Q8BXA6 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn17Q8BXA6 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn17Q8BXA6 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn17Q8BXA6 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn17Q8BXA6 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn17Q8BXA6 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn17Q8BXA6 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn17Q8BXA6 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn17Q8BXA6 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn17Q8BXA6 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn17Q8BXA6 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn17Q8BXA6 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn17Q8BXA6 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn17Q8BXA6 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn17Q8BXA6 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn17Q8BXA6 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn17Q8BXA6 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn17Q8BXA6 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn17Q8BXA6 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn17Q8BXA6 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn17Q8BXA6 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn17Q8BXA6 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn17Q8BXA6 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn17Q8BXA6 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn17Q8BXA6 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn17Q8BXA6 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn17Q8BXA6 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn17Q8BXA6 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn17Q8BXA6 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn17Q8BXA6 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn17Q8BXA6 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn17Q8BXA6 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn17Q8BXA6 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn17Q8BXA6 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn17Q8BXA6 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn17Q8BXA6 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn17Q8BXA6 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn17Q8BXA6 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn17Q8BXA6 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn17Q8BXA6 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn17Q8BXA6 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn17Q8BXA6 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn17Q8BXA6 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn17Q8BXA6 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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