Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX32

Slx1b, Structure-specific endonuclease subunit SLX1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx1bQ8BX32 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slx1bQ8BX32 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slx1bQ8BX32 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slx1bQ8BX32 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slx1bQ8BX32 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slx1bQ8BX32 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slx1bQ8BX32 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slx1bQ8BX32 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slx1bQ8BX32 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slx1bQ8BX32 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slx1bQ8BX32 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slx1bQ8BX32 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slx1bQ8BX32 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Slx1bQ8BX32 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slx1bQ8BX32 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slx1bQ8BX32 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slx1bQ8BX32 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slx1bQ8BX32 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slx1bQ8BX32 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slx1bQ8BX32 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slx1bQ8BX32 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Slx1bQ8BX32 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Slx1bQ8BX32 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Slx1bQ8BX32 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Slx1bQ8BX32 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Slx1bQ8BX32 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Slx1bQ8BX32 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slx1bQ8BX32 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Slx1bQ8BX32 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slx1bQ8BX32 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slx1bQ8BX32 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Slx1bQ8BX32 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slx1bQ8BX32 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Slx1bQ8BX32 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slx1bQ8BX32 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slx1bQ8BX32 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Slx1bQ8BX32 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slx1bQ8BX32 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slx1bQ8BX32 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slx1bQ8BX32 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slx1bQ8BX32 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slx1bQ8BX32 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slx1bQ8BX32 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slx1bQ8BX32 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slx1bQ8BX32 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slx1bQ8BX32 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slx1bQ8BX32 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slx1bQ8BX32 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slx1bQ8BX32 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slx1bQ8BX32 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slx1bQ8BX32 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slx1bQ8BX32 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slx1bQ8BX32 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slx1bQ8BX32 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Slx1bQ8BX32 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slx1bQ8BX32 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slx1bQ8BX32 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slx1bQ8BX32 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slx1bQ8BX32 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slx1bQ8BX32 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slx1bQ8BX32 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slx1bQ8BX32 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Slx1bQ8BX32 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slx1bQ8BX32 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slx1bQ8BX32 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slx1bQ8BX32 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slx1bQ8BX32 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slx1bQ8BX32 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slx1bQ8BX32 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slx1bQ8BX32 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slx1bQ8BX32 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slx1bQ8BX32 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slx1bQ8BX32 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slx1bQ8BX32 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slx1bQ8BX32 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slx1bQ8BX32 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slx1bQ8BX32 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slx1bQ8BX32 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slx1bQ8BX32 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slx1bQ8BX32 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Slx1bQ8BX32 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slx1bQ8BX32 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slx1bQ8BX32 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slx1bQ8BX32 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slx1bQ8BX32 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slx1bQ8BX32 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slx1bQ8BX32 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slx1bQ8BX32 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slx1bQ8BX32 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slx1bQ8BX32 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slx1bQ8BX32 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slx1bQ8BX32 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slx1bQ8BX32 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slx1bQ8BX32 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slx1bQ8BX32 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Slx1bQ8BX32 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slx1bQ8BX32 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slx1bQ8BX32 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slx1bQ8BX32 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slx1bQ8BX32 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms