Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbbp5Q8BX09 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbbp5Q8BX09 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbbp5Q8BX09 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbbp5Q8BX09 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbbp5Q8BX09 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbbp5Q8BX09 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbbp5Q8BX09 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbbp5Q8BX09 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbbp5Q8BX09 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbbp5Q8BX09 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbbp5Q8BX09 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbbp5Q8BX09 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbbp5Q8BX09 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbbp5Q8BX09 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbbp5Q8BX09 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbbp5Q8BX09 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbbp5Q8BX09 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbbp5Q8BX09 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbbp5Q8BX09 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbbp5Q8BX09 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbbp5Q8BX09 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbbp5Q8BX09 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbbp5Q8BX09 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbbp5Q8BX09 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbbp5Q8BX09 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbbp5Q8BX09 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbbp5Q8BX09 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbbp5Q8BX09 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbbp5Q8BX09 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbbp5Q8BX09 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbbp5Q8BX09 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbbp5Q8BX09 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbbp5Q8BX09 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbbp5Q8BX09 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbbp5Q8BX09 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbbp5Q8BX09 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbbp5Q8BX09 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbbp5Q8BX09 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbbp5Q8BX09 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbbp5Q8BX09 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rbbp5Q8BX09 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rbbp5Q8BX09 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rbbp5Q8BX09 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rbbp5Q8BX09 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rbbp5Q8BX09 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rbbp5Q8BX09 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rbbp5Q8BX09 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rbbp5Q8BX09 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rbbp5Q8BX09 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rbbp5Q8BX09 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rbbp5Q8BX09 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rbbp5Q8BX09 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rbbp5Q8BX09 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rbbp5Q8BX09 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rbbp5Q8BX09 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rbbp5Q8BX09 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rbbp5Q8BX09 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rbbp5Q8BX09 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rbbp5Q8BX09 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rbbp5Q8BX09 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rbbp5Q8BX09 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rbbp5Q8BX09 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Rbbp5Q8BX09 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Rbbp5Q8BX09 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rbbp5Q8BX09 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Rbbp5Q8BX09 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rbbp5Q8BX09 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rbbp5Q8BX09 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Rbbp5Q8BX09 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rbbp5Q8BX09 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rbbp5Q8BX09 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rbbp5Q8BX09 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rbbp5Q8BX09 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rbbp5Q8BX09 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rbbp5Q8BX09 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Rbbp5Q8BX09 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rbbp5Q8BX09 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rbbp5Q8BX09 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rbbp5Q8BX09 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rbbp5Q8BX09 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rbbp5Q8BX09 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rbbp5Q8BX09 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rbbp5Q8BX09 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Rbbp5Q8BX09 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rbbp5Q8BX09 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rbbp5Q8BX09 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rbbp5Q8BX09 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rbbp5Q8BX09 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rbbp5Q8BX09 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rbbp5Q8BX09 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Rbbp5Q8BX09 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rbbp5Q8BX09 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rbbp5Q8BX09 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rbbp5Q8BX09 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbbp5Q8BX09 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbbp5Q8BX09 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbbp5Q8BX09 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbbp5Q8BX09 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbbp5Q8BX09 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms