Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pggt1bQ8BUY9 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pggt1bQ8BUY9 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pggt1bQ8BUY9 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pggt1bQ8BUY9 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pggt1bQ8BUY9 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pggt1bQ8BUY9 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pggt1bQ8BUY9 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Pggt1bQ8BUY9 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pggt1bQ8BUY9 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pggt1bQ8BUY9 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Pggt1bQ8BUY9 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pggt1bQ8BUY9 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pggt1bQ8BUY9 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pggt1bQ8BUY9 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pggt1bQ8BUY9 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pggt1bQ8BUY9 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pggt1bQ8BUY9 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pggt1bQ8BUY9 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pggt1bQ8BUY9 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pggt1bQ8BUY9 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pggt1bQ8BUY9 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pggt1bQ8BUY9 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pggt1bQ8BUY9 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pggt1bQ8BUY9 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pggt1bQ8BUY9 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pggt1bQ8BUY9 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pggt1bQ8BUY9 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pggt1bQ8BUY9 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pggt1bQ8BUY9 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pggt1bQ8BUY9 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pggt1bQ8BUY9 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pggt1bQ8BUY9 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pggt1bQ8BUY9 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pggt1bQ8BUY9 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pggt1bQ8BUY9 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pggt1bQ8BUY9 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Pggt1bQ8BUY9 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pggt1bQ8BUY9 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
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Pggt1bQ8BUY9 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pggt1bQ8BUY9 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pggt1bQ8BUY9 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pggt1bQ8BUY9 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Pggt1bQ8BUY9 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pggt1bQ8BUY9 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pggt1bQ8BUY9 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
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Pggt1bQ8BUY9 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Pggt1bQ8BUY9 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pggt1bQ8BUY9 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pggt1bQ8BUY9 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pggt1bQ8BUY9 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Pggt1bQ8BUY9 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pggt1bQ8BUY9 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pggt1bQ8BUY9 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Pggt1bQ8BUY9 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Pggt1bQ8BUY9 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pggt1bQ8BUY9 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pggt1bQ8BUY9 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pggt1bQ8BUY9 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pggt1bQ8BUY9 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pggt1bQ8BUY9 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pggt1bQ8BUY9 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pggt1bQ8BUY9 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pggt1bQ8BUY9 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pggt1bQ8BUY9 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pggt1bQ8BUY9 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pggt1bQ8BUY9 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pggt1bQ8BUY9 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pggt1bQ8BUY9 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pggt1bQ8BUY9 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pggt1bQ8BUY9 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pggt1bQ8BUY9 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pggt1bQ8BUY9 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms