Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQ08

5730596B20Rik, RIKEN cDNA 5730596B20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5730596B20RikQ8BQ08 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Gm12088-201ENSMUST00000137364 520 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Gm15680-201ENSMUST00000161597 465 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Gm17063-201ENSMUST00000168135 456 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Gm9499-201ENSMUST00000180888 964 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Gm19253-201ENSMUST00000204279 307 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Olfr886-ps1-201ENSMUST00000212395 708 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Elobl-201ENSMUST00000061938 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Gm42449-201ENSMUST00000200349 2258 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Gm37160-201ENSMUST00000193081 1689 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Csn1s2b-203ENSMUST00000113279 745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Gm13033-201ENSMUST00000117591 1057 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 2310040G07Rik-202ENSMUST00000145897 462 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 4930486I03Rik-201ENSMUST00000161509 788 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Tcstv1-201ENSMUST00000178510 1280 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Ptma-201ENSMUST00000045897 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Olfr19-201ENSMUST00000057886 1142 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Csn1s2b-201ENSMUST00000072539 810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Ifi44l-201ENSMUST00000046739 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 AW495222-202ENSMUST00000149839 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Gm8582-201ENSMUST00000164061 789 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Vmn1r-ps143-201ENSMUST00000176730 604 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 1700122D07Rik-201ENSMUST00000186973 421 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Gm8480-201ENSMUST00000190350 698 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Gm36966-201ENSMUST00000192217 413 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.7 ms