Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF5

Grik4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik4Q8BMF5 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Grik4Q8BMF5 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Grik4Q8BMF5 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Grik4Q8BMF5 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Grik4Q8BMF5 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Grik4Q8BMF5 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Grik4Q8BMF5 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Grik4Q8BMF5 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Grik4Q8BMF5 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Grik4Q8BMF5 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Grik4Q8BMF5 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Grik4Q8BMF5 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Grik4Q8BMF5 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Grik4Q8BMF5 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Grik4Q8BMF5 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Grik4Q8BMF5 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Grik4Q8BMF5 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Grik4Q8BMF5 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Grik4Q8BMF5 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Grik4Q8BMF5 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Grik4Q8BMF5 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Grik4Q8BMF5 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Grik4Q8BMF5 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Grik4Q8BMF5 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Grik4Q8BMF5 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Grik4Q8BMF5 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Grik4Q8BMF5 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Grik4Q8BMF5 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Grik4Q8BMF5 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Grik4Q8BMF5 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Grik4Q8BMF5 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Grik4Q8BMF5 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Grik4Q8BMF5 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Grik4Q8BMF5 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Grik4Q8BMF5 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Grik4Q8BMF5 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Grik4Q8BMF5 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Grik4Q8BMF5 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Grik4Q8BMF5 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Grik4Q8BMF5 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Grik4Q8BMF5 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Grik4Q8BMF5 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Grik4Q8BMF5 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Grik4Q8BMF5 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Grik4Q8BMF5 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Grik4Q8BMF5 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Grik4Q8BMF5 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Grik4Q8BMF5 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Grik4Q8BMF5 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Grik4Q8BMF5 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Grik4Q8BMF5 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Grik4Q8BMF5 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Grik4Q8BMF5 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Grik4Q8BMF5 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Grik4Q8BMF5 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Grik4Q8BMF5 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Grik4Q8BMF5 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Grik4Q8BMF5 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Grik4Q8BMF5 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Grik4Q8BMF5 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Grik4Q8BMF5 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Grik4Q8BMF5 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Grik4Q8BMF5 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Grik4Q8BMF5 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Grik4Q8BMF5 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Grik4Q8BMF5 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Grik4Q8BMF5 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Grik4Q8BMF5 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Grik4Q8BMF5 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Grik4Q8BMF5 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Grik4Q8BMF5 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Grik4Q8BMF5 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Grik4Q8BMF5 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Grik4Q8BMF5 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Grik4Q8BMF5 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Grik4Q8BMF5 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Grik4Q8BMF5 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Grik4Q8BMF5 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Grik4Q8BMF5 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Grik4Q8BMF5 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Grik4Q8BMF5 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Grik4Q8BMF5 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Grik4Q8BMF5 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Grik4Q8BMF5 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Grik4Q8BMF5 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Grik4Q8BMF5 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Grik4Q8BMF5 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Grik4Q8BMF5 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Grik4Q8BMF5 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Grik4Q8BMF5 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Grik4Q8BMF5 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Grik4Q8BMF5 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Grik4Q8BMF5 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Grik4Q8BMF5 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Grik4Q8BMF5 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Grik4Q8BMF5 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Grik4Q8BMF5 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Grik4Q8BMF5 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Grik4Q8BMF5 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grik4Q8BMF5 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms