Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKW4

Zcchc4, Zinc finger CCHC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc4Q8BKW4 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms