Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKT6

Tspan12, Tetraspanin-12, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan12Q8BKT6 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tspan12Q8BKT6 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms