Protein–RNA interactions for Protein: Q8BII3

D130040H23Rik, RIKEN cDNA D130040H23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130040H23RikQ8BII3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
D130040H23RikQ8BII3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
D130040H23RikQ8BII3 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
D130040H23RikQ8BII3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
D130040H23RikQ8BII3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
D130040H23RikQ8BII3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
D130040H23RikQ8BII3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
D130040H23RikQ8BII3 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
D130040H23RikQ8BII3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
D130040H23RikQ8BII3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
D130040H23RikQ8BII3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
D130040H23RikQ8BII3 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
D130040H23RikQ8BII3 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
D130040H23RikQ8BII3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
D130040H23RikQ8BII3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
D130040H23RikQ8BII3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
D130040H23RikQ8BII3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
D130040H23RikQ8BII3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
D130040H23RikQ8BII3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
D130040H23RikQ8BII3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
D130040H23RikQ8BII3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
D130040H23RikQ8BII3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
D130040H23RikQ8BII3 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
D130040H23RikQ8BII3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
D130040H23RikQ8BII3 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
D130040H23RikQ8BII3 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
D130040H23RikQ8BII3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
D130040H23RikQ8BII3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
D130040H23RikQ8BII3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
D130040H23RikQ8BII3 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
D130040H23RikQ8BII3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
D130040H23RikQ8BII3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
D130040H23RikQ8BII3 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
D130040H23RikQ8BII3 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
D130040H23RikQ8BII3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
D130040H23RikQ8BII3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
D130040H23RikQ8BII3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
D130040H23RikQ8BII3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
D130040H23RikQ8BII3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
D130040H23RikQ8BII3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
D130040H23RikQ8BII3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
D130040H23RikQ8BII3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
D130040H23RikQ8BII3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
D130040H23RikQ8BII3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
D130040H23RikQ8BII3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
D130040H23RikQ8BII3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
D130040H23RikQ8BII3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
D130040H23RikQ8BII3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
D130040H23RikQ8BII3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
D130040H23RikQ8BII3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
D130040H23RikQ8BII3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
D130040H23RikQ8BII3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
D130040H23RikQ8BII3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
D130040H23RikQ8BII3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
D130040H23RikQ8BII3 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
D130040H23RikQ8BII3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
D130040H23RikQ8BII3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
D130040H23RikQ8BII3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
D130040H23RikQ8BII3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
D130040H23RikQ8BII3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
D130040H23RikQ8BII3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
D130040H23RikQ8BII3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
D130040H23RikQ8BII3 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
D130040H23RikQ8BII3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
D130040H23RikQ8BII3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
D130040H23RikQ8BII3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
D130040H23RikQ8BII3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
D130040H23RikQ8BII3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
D130040H23RikQ8BII3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
D130040H23RikQ8BII3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
D130040H23RikQ8BII3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
D130040H23RikQ8BII3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
D130040H23RikQ8BII3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
D130040H23RikQ8BII3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
D130040H23RikQ8BII3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
D130040H23RikQ8BII3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
D130040H23RikQ8BII3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
D130040H23RikQ8BII3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
D130040H23RikQ8BII3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
D130040H23RikQ8BII3 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
D130040H23RikQ8BII3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
D130040H23RikQ8BII3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
D130040H23RikQ8BII3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
D130040H23RikQ8BII3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
D130040H23RikQ8BII3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
D130040H23RikQ8BII3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
D130040H23RikQ8BII3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
D130040H23RikQ8BII3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
D130040H23RikQ8BII3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
D130040H23RikQ8BII3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
D130040H23RikQ8BII3 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
D130040H23RikQ8BII3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
D130040H23RikQ8BII3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
D130040H23RikQ8BII3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
D130040H23RikQ8BII3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
D130040H23RikQ8BII3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
D130040H23RikQ8BII3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
D130040H23RikQ8BII3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
D130040H23RikQ8BII3 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
D130040H23RikQ8BII3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms