Protein–RNA interactions for Protein: Q8BII1

Prox2, Prospero homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox2Q8BII1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prox2Q8BII1 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prox2Q8BII1 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prox2Q8BII1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prox2Q8BII1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prox2Q8BII1 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prox2Q8BII1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prox2Q8BII1 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prox2Q8BII1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prox2Q8BII1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prox2Q8BII1 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prox2Q8BII1 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prox2Q8BII1 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prox2Q8BII1 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prox2Q8BII1 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prox2Q8BII1 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prox2Q8BII1 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prox2Q8BII1 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prox2Q8BII1 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prox2Q8BII1 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prox2Q8BII1 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prox2Q8BII1 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prox2Q8BII1 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prox2Q8BII1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prox2Q8BII1 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prox2Q8BII1 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prox2Q8BII1 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prox2Q8BII1 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prox2Q8BII1 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prox2Q8BII1 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prox2Q8BII1 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prox2Q8BII1 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prox2Q8BII1 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prox2Q8BII1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prox2Q8BII1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prox2Q8BII1 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Prox2Q8BII1 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Prox2Q8BII1 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Prox2Q8BII1 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prox2Q8BII1 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prox2Q8BII1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prox2Q8BII1 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prox2Q8BII1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prox2Q8BII1 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prox2Q8BII1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prox2Q8BII1 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prox2Q8BII1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prox2Q8BII1 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prox2Q8BII1 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prox2Q8BII1 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Prox2Q8BII1 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Prox2Q8BII1 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prox2Q8BII1 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prox2Q8BII1 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prox2Q8BII1 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prox2Q8BII1 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prox2Q8BII1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prox2Q8BII1 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prox2Q8BII1 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prox2Q8BII1 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prox2Q8BII1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Prox2Q8BII1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prox2Q8BII1 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prox2Q8BII1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prox2Q8BII1 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prox2Q8BII1 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prox2Q8BII1 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prox2Q8BII1 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prox2Q8BII1 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prox2Q8BII1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prox2Q8BII1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prox2Q8BII1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prox2Q8BII1 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prox2Q8BII1 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prox2Q8BII1 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prox2Q8BII1 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prox2Q8BII1 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prox2Q8BII1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prox2Q8BII1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prox2Q8BII1 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prox2Q8BII1 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prox2Q8BII1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prox2Q8BII1 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prox2Q8BII1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prox2Q8BII1 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prox2Q8BII1 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prox2Q8BII1 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prox2Q8BII1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prox2Q8BII1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Prox2Q8BII1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prox2Q8BII1 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prox2Q8BII1 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prox2Q8BII1 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Prox2Q8BII1 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Prox2Q8BII1 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Prox2Q8BII1 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prox2Q8BII1 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prox2Q8BII1 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prox2Q8BII1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prox2Q8BII1 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms