Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHL8

Psmf1, Proteasome inhibitor PI31 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmf1Q8BHL8 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmf1Q8BHL8 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmf1Q8BHL8 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmf1Q8BHL8 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmf1Q8BHL8 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmf1Q8BHL8 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmf1Q8BHL8 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmf1Q8BHL8 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmf1Q8BHL8 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmf1Q8BHL8 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmf1Q8BHL8 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmf1Q8BHL8 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmf1Q8BHL8 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmf1Q8BHL8 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmf1Q8BHL8 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmf1Q8BHL8 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmf1Q8BHL8 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmf1Q8BHL8 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmf1Q8BHL8 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmf1Q8BHL8 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmf1Q8BHL8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmf1Q8BHL8 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmf1Q8BHL8 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmf1Q8BHL8 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmf1Q8BHL8 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmf1Q8BHL8 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmf1Q8BHL8 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmf1Q8BHL8 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmf1Q8BHL8 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmf1Q8BHL8 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmf1Q8BHL8 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmf1Q8BHL8 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmf1Q8BHL8 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmf1Q8BHL8 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmf1Q8BHL8 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmf1Q8BHL8 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmf1Q8BHL8 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmf1Q8BHL8 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmf1Q8BHL8 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmf1Q8BHL8 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmf1Q8BHL8 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmf1Q8BHL8 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmf1Q8BHL8 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmf1Q8BHL8 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmf1Q8BHL8 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmf1Q8BHL8 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmf1Q8BHL8 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmf1Q8BHL8 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmf1Q8BHL8 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmf1Q8BHL8 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmf1Q8BHL8 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmf1Q8BHL8 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmf1Q8BHL8 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmf1Q8BHL8 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmf1Q8BHL8 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmf1Q8BHL8 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmf1Q8BHL8 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmf1Q8BHL8 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmf1Q8BHL8 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmf1Q8BHL8 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmf1Q8BHL8 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmf1Q8BHL8 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmf1Q8BHL8 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmf1Q8BHL8 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmf1Q8BHL8 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmf1Q8BHL8 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmf1Q8BHL8 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmf1Q8BHL8 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmf1Q8BHL8 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmf1Q8BHL8 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmf1Q8BHL8 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmf1Q8BHL8 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmf1Q8BHL8 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmf1Q8BHL8 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmf1Q8BHL8 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmf1Q8BHL8 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmf1Q8BHL8 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmf1Q8BHL8 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmf1Q8BHL8 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmf1Q8BHL8 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmf1Q8BHL8 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmf1Q8BHL8 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmf1Q8BHL8 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmf1Q8BHL8 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmf1Q8BHL8 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmf1Q8BHL8 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmf1Q8BHL8 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmf1Q8BHL8 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmf1Q8BHL8 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmf1Q8BHL8 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmf1Q8BHL8 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmf1Q8BHL8 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmf1Q8BHL8 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmf1Q8BHL8 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmf1Q8BHL8 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmf1Q8BHL8 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmf1Q8BHL8 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmf1Q8BHL8 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmf1Q8BHL8 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmf1Q8BHL8 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms