Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGQ1

Vipas39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Vipas39Q8BGQ1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vipas39Q8BGQ1 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vipas39Q8BGQ1 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vipas39Q8BGQ1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vipas39Q8BGQ1 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vipas39Q8BGQ1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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Vipas39Q8BGQ1 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vipas39Q8BGQ1 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vipas39Q8BGQ1 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vipas39Q8BGQ1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vipas39Q8BGQ1 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
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Vipas39Q8BGQ1 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vipas39Q8BGQ1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vipas39Q8BGQ1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vipas39Q8BGQ1 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vipas39Q8BGQ1 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vipas39Q8BGQ1 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vipas39Q8BGQ1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vipas39Q8BGQ1 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vipas39Q8BGQ1 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
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Vipas39Q8BGQ1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
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Vipas39Q8BGQ1 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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Vipas39Q8BGQ1 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vipas39Q8BGQ1 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vipas39Q8BGQ1 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vipas39Q8BGQ1 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vipas39Q8BGQ1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vipas39Q8BGQ1 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vipas39Q8BGQ1 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vipas39Q8BGQ1 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vipas39Q8BGQ1 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vipas39Q8BGQ1 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vipas39Q8BGQ1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vipas39Q8BGQ1 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vipas39Q8BGQ1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vipas39Q8BGQ1 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vipas39Q8BGQ1 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vipas39Q8BGQ1 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vipas39Q8BGQ1 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vipas39Q8BGQ1 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
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