Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGP6

Slc25a40, Solute carrier family 25 member 40, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc25a40Q8BGP6 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc25a40Q8BGP6 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc25a40Q8BGP6 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc25a40Q8BGP6 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc25a40Q8BGP6 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc25a40Q8BGP6 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc25a40Q8BGP6 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc25a40Q8BGP6 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc25a40Q8BGP6 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc25a40Q8BGP6 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc25a40Q8BGP6 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc25a40Q8BGP6 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc25a40Q8BGP6 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc25a40Q8BGP6 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc25a40Q8BGP6 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc25a40Q8BGP6 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc25a40Q8BGP6 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc25a40Q8BGP6 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc25a40Q8BGP6 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc25a40Q8BGP6 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc25a40Q8BGP6 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc25a40Q8BGP6 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc25a40Q8BGP6 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc25a40Q8BGP6 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc25a40Q8BGP6 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc25a40Q8BGP6 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc25a40Q8BGP6 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc25a40Q8BGP6 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc25a40Q8BGP6 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc25a40Q8BGP6 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc25a40Q8BGP6 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc25a40Q8BGP6 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc25a40Q8BGP6 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc25a40Q8BGP6 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc25a40Q8BGP6 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc25a40Q8BGP6 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc25a40Q8BGP6 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc25a40Q8BGP6 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc25a40Q8BGP6 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc25a40Q8BGP6 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc25a40Q8BGP6 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc25a40Q8BGP6 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc25a40Q8BGP6 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc25a40Q8BGP6 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc25a40Q8BGP6 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc25a40Q8BGP6 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc25a40Q8BGP6 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc25a40Q8BGP6 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc25a40Q8BGP6 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc25a40Q8BGP6 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc25a40Q8BGP6 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc25a40Q8BGP6 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc25a40Q8BGP6 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc25a40Q8BGP6 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc25a40Q8BGP6 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc25a40Q8BGP6 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc25a40Q8BGP6 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc25a40Q8BGP6 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc25a40Q8BGP6 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc25a40Q8BGP6 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc25a40Q8BGP6 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc25a40Q8BGP6 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc25a40Q8BGP6 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc25a40Q8BGP6 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc25a40Q8BGP6 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc25a40Q8BGP6 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc25a40Q8BGP6 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc25a40Q8BGP6 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc25a40Q8BGP6 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc25a40Q8BGP6 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc25a40Q8BGP6 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc25a40Q8BGP6 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc25a40Q8BGP6 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc25a40Q8BGP6 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc25a40Q8BGP6 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc25a40Q8BGP6 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc25a40Q8BGP6 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc25a40Q8BGP6 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc25a40Q8BGP6 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc25a40Q8BGP6 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc25a40Q8BGP6 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc25a40Q8BGP6 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc25a40Q8BGP6 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc25a40Q8BGP6 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc25a40Q8BGP6 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc25a40Q8BGP6 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc25a40Q8BGP6 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc25a40Q8BGP6 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc25a40Q8BGP6 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc25a40Q8BGP6 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc25a40Q8BGP6 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc25a40Q8BGP6 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc25a40Q8BGP6 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc25a40Q8BGP6 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc25a40Q8BGP6 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc25a40Q8BGP6 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc25a40Q8BGP6 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc25a40Q8BGP6 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc25a40Q8BGP6 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc25a40Q8BGP6 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms