Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGM5

Best2, Bestrophin-2, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Best2Q8BGM5 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Best2Q8BGM5 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Best2Q8BGM5 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Best2Q8BGM5 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Best2Q8BGM5 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Best2Q8BGM5 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Best2Q8BGM5 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Best2Q8BGM5 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Best2Q8BGM5 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Best2Q8BGM5 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Best2Q8BGM5 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Best2Q8BGM5 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Best2Q8BGM5 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Best2Q8BGM5 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Best2Q8BGM5 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Best2Q8BGM5 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Best2Q8BGM5 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Best2Q8BGM5 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Best2Q8BGM5 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Best2Q8BGM5 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Best2Q8BGM5 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Best2Q8BGM5 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Best2Q8BGM5 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Best2Q8BGM5 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Best2Q8BGM5 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Best2Q8BGM5 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Best2Q8BGM5 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Best2Q8BGM5 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Best2Q8BGM5 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Best2Q8BGM5 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Best2Q8BGM5 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Best2Q8BGM5 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Best2Q8BGM5 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Best2Q8BGM5 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Best2Q8BGM5 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Best2Q8BGM5 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Best2Q8BGM5 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Best2Q8BGM5 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Best2Q8BGM5 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Best2Q8BGM5 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Best2Q8BGM5 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Best2Q8BGM5 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Best2Q8BGM5 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Best2Q8BGM5 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Best2Q8BGM5 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Best2Q8BGM5 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Best2Q8BGM5 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Best2Q8BGM5 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Best2Q8BGM5 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Best2Q8BGM5 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Best2Q8BGM5 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Best2Q8BGM5 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Best2Q8BGM5 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Best2Q8BGM5 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Best2Q8BGM5 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Best2Q8BGM5 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Best2Q8BGM5 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Best2Q8BGM5 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Best2Q8BGM5 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Best2Q8BGM5 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Best2Q8BGM5 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Best2Q8BGM5 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Best2Q8BGM5 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Best2Q8BGM5 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Best2Q8BGM5 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Best2Q8BGM5 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Best2Q8BGM5 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Best2Q8BGM5 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Best2Q8BGM5 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Best2Q8BGM5 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Best2Q8BGM5 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Best2Q8BGM5 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Best2Q8BGM5 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Best2Q8BGM5 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Best2Q8BGM5 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Best2Q8BGM5 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Best2Q8BGM5 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Best2Q8BGM5 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Best2Q8BGM5 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Best2Q8BGM5 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Best2Q8BGM5 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Best2Q8BGM5 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Best2Q8BGM5 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Best2Q8BGM5 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Best2Q8BGM5 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Best2Q8BGM5 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Best2Q8BGM5 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Best2Q8BGM5 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Best2Q8BGM5 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Best2Q8BGM5 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Best2Q8BGM5 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Best2Q8BGM5 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Best2Q8BGM5 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Best2Q8BGM5 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Best2Q8BGM5 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Best2Q8BGM5 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Best2Q8BGM5 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Best2Q8BGM5 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Best2Q8BGM5 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Best2Q8BGM5 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms