Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

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Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubash3bQ8BGG7 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubash3bQ8BGG7 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubash3bQ8BGG7 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubash3bQ8BGG7 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubash3bQ8BGG7 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubash3bQ8BGG7 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubash3bQ8BGG7 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubash3bQ8BGG7 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ubash3bQ8BGG7 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ubash3bQ8BGG7 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ubash3bQ8BGG7 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubash3bQ8BGG7 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubash3bQ8BGG7 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubash3bQ8BGG7 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubash3bQ8BGG7 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubash3bQ8BGG7 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubash3bQ8BGG7 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubash3bQ8BGG7 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubash3bQ8BGG7 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubash3bQ8BGG7 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubash3bQ8BGG7 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubash3bQ8BGG7 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubash3bQ8BGG7 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubash3bQ8BGG7 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubash3bQ8BGG7 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubash3bQ8BGG7 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubash3bQ8BGG7 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubash3bQ8BGG7 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubash3bQ8BGG7 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubash3bQ8BGG7 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubash3bQ8BGG7 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubash3bQ8BGG7 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubash3bQ8BGG7 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubash3bQ8BGG7 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubash3bQ8BGG7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubash3bQ8BGG7 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubash3bQ8BGG7 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubash3bQ8BGG7 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubash3bQ8BGG7 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubash3bQ8BGG7 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubash3bQ8BGG7 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubash3bQ8BGG7 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubash3bQ8BGG7 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubash3bQ8BGG7 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubash3bQ8BGG7 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubash3bQ8BGG7 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubash3bQ8BGG7 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubash3bQ8BGG7 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubash3bQ8BGG7 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubash3bQ8BGG7 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubash3bQ8BGG7 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubash3bQ8BGG7 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubash3bQ8BGG7 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubash3bQ8BGG7 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubash3bQ8BGG7 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubash3bQ8BGG7 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubash3bQ8BGG7 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubash3bQ8BGG7 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubash3bQ8BGG7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubash3bQ8BGG7 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubash3bQ8BGG7 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubash3bQ8BGG7 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubash3bQ8BGG7 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Ubash3bQ8BGG7 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubash3bQ8BGG7 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubash3bQ8BGG7 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubash3bQ8BGG7 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubash3bQ8BGG7 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubash3bQ8BGG7 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubash3bQ8BGG7 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubash3bQ8BGG7 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubash3bQ8BGG7 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubash3bQ8BGG7 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubash3bQ8BGG7 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubash3bQ8BGG7 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubash3bQ8BGG7 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubash3bQ8BGG7 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubash3bQ8BGG7 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubash3bQ8BGG7 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubash3bQ8BGG7 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubash3bQ8BGG7 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubash3bQ8BGG7 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubash3bQ8BGG7 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubash3bQ8BGG7 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubash3bQ8BGG7 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubash3bQ8BGG7 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubash3bQ8BGG7 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubash3bQ8BGG7 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubash3bQ8BGG7 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubash3bQ8BGG7 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubash3bQ8BGG7 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubash3bQ8BGG7 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubash3bQ8BGG7 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubash3bQ8BGG7 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubash3bQ8BGG7 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubash3bQ8BGG7 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubash3bQ8BGG7 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubash3bQ8BGG7 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms