Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg4bQ8BGE6 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg4bQ8BGE6 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg4bQ8BGE6 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg4bQ8BGE6 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg4bQ8BGE6 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg4bQ8BGE6 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg4bQ8BGE6 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg4bQ8BGE6 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg4bQ8BGE6 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg4bQ8BGE6 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg4bQ8BGE6 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg4bQ8BGE6 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg4bQ8BGE6 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg4bQ8BGE6 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg4bQ8BGE6 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg4bQ8BGE6 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg4bQ8BGE6 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg4bQ8BGE6 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg4bQ8BGE6 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg4bQ8BGE6 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg4bQ8BGE6 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg4bQ8BGE6 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg4bQ8BGE6 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg4bQ8BGE6 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg4bQ8BGE6 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg4bQ8BGE6 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg4bQ8BGE6 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg4bQ8BGE6 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg4bQ8BGE6 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg4bQ8BGE6 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg4bQ8BGE6 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg4bQ8BGE6 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg4bQ8BGE6 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg4bQ8BGE6 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg4bQ8BGE6 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg4bQ8BGE6 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg4bQ8BGE6 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg4bQ8BGE6 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg4bQ8BGE6 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg4bQ8BGE6 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg4bQ8BGE6 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg4bQ8BGE6 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg4bQ8BGE6 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg4bQ8BGE6 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg4bQ8BGE6 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg4bQ8BGE6 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg4bQ8BGE6 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg4bQ8BGE6 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg4bQ8BGE6 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg4bQ8BGE6 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg4bQ8BGE6 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg4bQ8BGE6 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Atg4bQ8BGE6 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg4bQ8BGE6 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms