Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Htatsf1Q8BGC0 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Htatsf1Q8BGC0 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Htatsf1Q8BGC0 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Htatsf1Q8BGC0 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Htatsf1Q8BGC0 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Htatsf1Q8BGC0 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Htatsf1Q8BGC0 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Htatsf1Q8BGC0 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Htatsf1Q8BGC0 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Htatsf1Q8BGC0 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Htatsf1Q8BGC0 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Htatsf1Q8BGC0 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Htatsf1Q8BGC0 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Htatsf1Q8BGC0 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Htatsf1Q8BGC0 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Htatsf1Q8BGC0 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Htatsf1Q8BGC0 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Htatsf1Q8BGC0 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Htatsf1Q8BGC0 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Htatsf1Q8BGC0 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Htatsf1Q8BGC0 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Htatsf1Q8BGC0 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Htatsf1Q8BGC0 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Htatsf1Q8BGC0 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Htatsf1Q8BGC0 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Htatsf1Q8BGC0 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Htatsf1Q8BGC0 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Htatsf1Q8BGC0 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Htatsf1Q8BGC0 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Htatsf1Q8BGC0 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Htatsf1Q8BGC0 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Htatsf1Q8BGC0 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Htatsf1Q8BGC0 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Htatsf1Q8BGC0 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Htatsf1Q8BGC0 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Htatsf1Q8BGC0 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Htatsf1Q8BGC0 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Htatsf1Q8BGC0 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Htatsf1Q8BGC0 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Htatsf1Q8BGC0 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Htatsf1Q8BGC0 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Htatsf1Q8BGC0 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Htatsf1Q8BGC0 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Htatsf1Q8BGC0 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Htatsf1Q8BGC0 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Htatsf1Q8BGC0 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Htatsf1Q8BGC0 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Htatsf1Q8BGC0 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Htatsf1Q8BGC0 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Htatsf1Q8BGC0 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Htatsf1Q8BGC0 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Htatsf1Q8BGC0 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Htatsf1Q8BGC0 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Htatsf1Q8BGC0 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Htatsf1Q8BGC0 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Htatsf1Q8BGC0 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Htatsf1Q8BGC0 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Htatsf1Q8BGC0 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Htatsf1Q8BGC0 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Htatsf1Q8BGC0 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Htatsf1Q8BGC0 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Htatsf1Q8BGC0 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Htatsf1Q8BGC0 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Htatsf1Q8BGC0 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Htatsf1Q8BGC0 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Htatsf1Q8BGC0 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Htatsf1Q8BGC0 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Htatsf1Q8BGC0 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Htatsf1Q8BGC0 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Htatsf1Q8BGC0 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Htatsf1Q8BGC0 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Htatsf1Q8BGC0 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Htatsf1Q8BGC0 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Htatsf1Q8BGC0 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Htatsf1Q8BGC0 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Htatsf1Q8BGC0 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Htatsf1Q8BGC0 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Htatsf1Q8BGC0 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Htatsf1Q8BGC0 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Htatsf1Q8BGC0 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Htatsf1Q8BGC0 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Htatsf1Q8BGC0 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Htatsf1Q8BGC0 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Htatsf1Q8BGC0 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Htatsf1Q8BGC0 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Htatsf1Q8BGC0 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Htatsf1Q8BGC0 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Htatsf1Q8BGC0 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Htatsf1Q8BGC0 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Htatsf1Q8BGC0 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Htatsf1Q8BGC0 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Htatsf1Q8BGC0 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Htatsf1Q8BGC0 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Htatsf1Q8BGC0 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Htatsf1Q8BGC0 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Htatsf1Q8BGC0 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Htatsf1Q8BGC0 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Htatsf1Q8BGC0 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Htatsf1Q8BGC0 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms