Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG71

Trmt12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt12Q8BG71 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trmt12Q8BG71 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trmt12Q8BG71 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Trmt12Q8BG71 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trmt12Q8BG71 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trmt12Q8BG71 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trmt12Q8BG71 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trmt12Q8BG71 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trmt12Q8BG71 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trmt12Q8BG71 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trmt12Q8BG71 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trmt12Q8BG71 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trmt12Q8BG71 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trmt12Q8BG71 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trmt12Q8BG71 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trmt12Q8BG71 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trmt12Q8BG71 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trmt12Q8BG71 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trmt12Q8BG71 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trmt12Q8BG71 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trmt12Q8BG71 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trmt12Q8BG71 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trmt12Q8BG71 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trmt12Q8BG71 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trmt12Q8BG71 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trmt12Q8BG71 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trmt12Q8BG71 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trmt12Q8BG71 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trmt12Q8BG71 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Trmt12Q8BG71 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trmt12Q8BG71 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trmt12Q8BG71 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trmt12Q8BG71 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trmt12Q8BG71 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trmt12Q8BG71 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trmt12Q8BG71 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trmt12Q8BG71 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trmt12Q8BG71 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trmt12Q8BG71 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trmt12Q8BG71 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trmt12Q8BG71 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trmt12Q8BG71 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trmt12Q8BG71 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trmt12Q8BG71 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trmt12Q8BG71 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trmt12Q8BG71 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trmt12Q8BG71 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trmt12Q8BG71 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trmt12Q8BG71 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trmt12Q8BG71 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trmt12Q8BG71 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trmt12Q8BG71 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trmt12Q8BG71 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Trmt12Q8BG71 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trmt12Q8BG71 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trmt12Q8BG71 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trmt12Q8BG71 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trmt12Q8BG71 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trmt12Q8BG71 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trmt12Q8BG71 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trmt12Q8BG71 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trmt12Q8BG71 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trmt12Q8BG71 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trmt12Q8BG71 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trmt12Q8BG71 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trmt12Q8BG71 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trmt12Q8BG71 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trmt12Q8BG71 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trmt12Q8BG71 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trmt12Q8BG71 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Trmt12Q8BG71 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trmt12Q8BG71 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trmt12Q8BG71 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trmt12Q8BG71 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trmt12Q8BG71 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trmt12Q8BG71 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trmt12Q8BG71 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Trmt12Q8BG71 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trmt12Q8BG71 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trmt12Q8BG71 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trmt12Q8BG71 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trmt12Q8BG71 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trmt12Q8BG71 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trmt12Q8BG71 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trmt12Q8BG71 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trmt12Q8BG71 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trmt12Q8BG71 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trmt12Q8BG71 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trmt12Q8BG71 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trmt12Q8BG71 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Trmt12Q8BG71 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trmt12Q8BG71 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Trmt12Q8BG71 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Trmt12Q8BG71 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trmt12Q8BG71 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trmt12Q8BG71 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trmt12Q8BG71 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trmt12Q8BG71 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trmt12Q8BG71 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Trmt12Q8BG71 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms