Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG40

Katnb1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Katnb1Q8BG40 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Katnb1Q8BG40 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Katnb1Q8BG40 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Katnb1Q8BG40 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Katnb1Q8BG40 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Katnb1Q8BG40 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Katnb1Q8BG40 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Katnb1Q8BG40 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Katnb1Q8BG40 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Katnb1Q8BG40 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Katnb1Q8BG40 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Katnb1Q8BG40 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Katnb1Q8BG40 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Katnb1Q8BG40 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Katnb1Q8BG40 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Katnb1Q8BG40 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Katnb1Q8BG40 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Katnb1Q8BG40 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Katnb1Q8BG40 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Katnb1Q8BG40 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Katnb1Q8BG40 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Katnb1Q8BG40 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Katnb1Q8BG40 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Katnb1Q8BG40 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Katnb1Q8BG40 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Katnb1Q8BG40 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Katnb1Q8BG40 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Katnb1Q8BG40 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Katnb1Q8BG40 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Katnb1Q8BG40 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Katnb1Q8BG40 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Katnb1Q8BG40 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Katnb1Q8BG40 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Katnb1Q8BG40 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Katnb1Q8BG40 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Katnb1Q8BG40 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Katnb1Q8BG40 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Katnb1Q8BG40 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Katnb1Q8BG40 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Katnb1Q8BG40 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Katnb1Q8BG40 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Katnb1Q8BG40 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Katnb1Q8BG40 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Katnb1Q8BG40 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Katnb1Q8BG40 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Katnb1Q8BG40 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Katnb1Q8BG40 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Katnb1Q8BG40 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Katnb1Q8BG40 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Katnb1Q8BG40 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Katnb1Q8BG40 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Katnb1Q8BG40 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Katnb1Q8BG40 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Katnb1Q8BG40 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Katnb1Q8BG40 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Katnb1Q8BG40 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Katnb1Q8BG40 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Katnb1Q8BG40 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Katnb1Q8BG40 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Katnb1Q8BG40 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Katnb1Q8BG40 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Katnb1Q8BG40 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Katnb1Q8BG40 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Katnb1Q8BG40 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Katnb1Q8BG40 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Katnb1Q8BG40 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Katnb1Q8BG40 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Katnb1Q8BG40 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Katnb1Q8BG40 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Katnb1Q8BG40 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Katnb1Q8BG40 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Katnb1Q8BG40 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Katnb1Q8BG40 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Katnb1Q8BG40 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Katnb1Q8BG40 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Katnb1Q8BG40 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Katnb1Q8BG40 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Katnb1Q8BG40 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Katnb1Q8BG40 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Katnb1Q8BG40 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Katnb1Q8BG40 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Katnb1Q8BG40 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Katnb1Q8BG40 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Katnb1Q8BG40 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Katnb1Q8BG40 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Katnb1Q8BG40 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Katnb1Q8BG40 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Katnb1Q8BG40 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Katnb1Q8BG40 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Katnb1Q8BG40 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Katnb1Q8BG40 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Katnb1Q8BG40 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Katnb1Q8BG40 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Katnb1Q8BG40 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Katnb1Q8BG40 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Katnb1Q8BG40 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Katnb1Q8BG40 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Katnb1Q8BG40 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Katnb1Q8BG40 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Katnb1Q8BG40 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms