Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFT6

Jmjd4, JmjC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 427 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd4Q8BFT6 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Jmjd4Q8BFT6 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Jmjd4Q8BFT6 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Jmjd4Q8BFT6 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Jmjd4Q8BFT6 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Jmjd4Q8BFT6 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Jmjd4Q8BFT6 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Jmjd4Q8BFT6 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Jmjd4Q8BFT6 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Jmjd4Q8BFT6 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Jmjd4Q8BFT6 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Jmjd4Q8BFT6 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Jmjd4Q8BFT6 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Jmjd4Q8BFT6 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Jmjd4Q8BFT6 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Jmjd4Q8BFT6 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Jmjd4Q8BFT6 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Jmjd4Q8BFT6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Jmjd4Q8BFT6 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Jmjd4Q8BFT6 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Jmjd4Q8BFT6 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Jmjd4Q8BFT6 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Jmjd4Q8BFT6 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Jmjd4Q8BFT6 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Jmjd4Q8BFT6 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Jmjd4Q8BFT6 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Jmjd4Q8BFT6 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Jmjd4Q8BFT6 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Jmjd4Q8BFT6 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Jmjd4Q8BFT6 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Jmjd4Q8BFT6 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Jmjd4Q8BFT6 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Jmjd4Q8BFT6 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Jmjd4Q8BFT6 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Jmjd4Q8BFT6 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Jmjd4Q8BFT6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Jmjd4Q8BFT6 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Jmjd4Q8BFT6 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Jmjd4Q8BFT6 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Jmjd4Q8BFT6 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Jmjd4Q8BFT6 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Jmjd4Q8BFT6 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Jmjd4Q8BFT6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Jmjd4Q8BFT6 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Jmjd4Q8BFT6 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Jmjd4Q8BFT6 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Jmjd4Q8BFT6 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Jmjd4Q8BFT6 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Jmjd4Q8BFT6 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Jmjd4Q8BFT6 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Jmjd4Q8BFT6 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Jmjd4Q8BFT6 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Jmjd4Q8BFT6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Jmjd4Q8BFT6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Jmjd4Q8BFT6 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Jmjd4Q8BFT6 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Jmjd4Q8BFT6 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Jmjd4Q8BFT6 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Jmjd4Q8BFT6 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Jmjd4Q8BFT6 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Jmjd4Q8BFT6 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Jmjd4Q8BFT6 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Jmjd4Q8BFT6 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Jmjd4Q8BFT6 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Jmjd4Q8BFT6 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Jmjd4Q8BFT6 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Jmjd4Q8BFT6 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Jmjd4Q8BFT6 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Jmjd4Q8BFT6 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Jmjd4Q8BFT6 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Jmjd4Q8BFT6 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Jmjd4Q8BFT6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Jmjd4Q8BFT6 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Jmjd4Q8BFT6 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Jmjd4Q8BFT6 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Jmjd4Q8BFT6 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Jmjd4Q8BFT6 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Jmjd4Q8BFT6 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Jmjd4Q8BFT6 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Jmjd4Q8BFT6 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Jmjd4Q8BFT6 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Jmjd4Q8BFT6 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Jmjd4Q8BFT6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Jmjd4Q8BFT6 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Jmjd4Q8BFT6 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Jmjd4Q8BFT6 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Jmjd4Q8BFT6 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Jmjd4Q8BFT6 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Jmjd4Q8BFT6 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Jmjd4Q8BFT6 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Jmjd4Q8BFT6 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Jmjd4Q8BFT6 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Jmjd4Q8BFT6 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Jmjd4Q8BFT6 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Jmjd4Q8BFT6 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Jmjd4Q8BFT6 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Jmjd4Q8BFT6 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Jmjd4Q8BFT6 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Jmjd4Q8BFT6 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Jmjd4Q8BFT6 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms