Protein–RNA interactions for Protein: Q810M6

Liat1, Protein LIAT1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Liat1Q810M6 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Liat1Q810M6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Liat1Q810M6 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Liat1Q810M6 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Liat1Q810M6 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Liat1Q810M6 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Liat1Q810M6 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Liat1Q810M6 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Liat1Q810M6 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Liat1Q810M6 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Liat1Q810M6 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Liat1Q810M6 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Liat1Q810M6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Liat1Q810M6 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Liat1Q810M6 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Liat1Q810M6 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Liat1Q810M6 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Liat1Q810M6 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Liat1Q810M6 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Liat1Q810M6 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Liat1Q810M6 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Liat1Q810M6 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Liat1Q810M6 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Liat1Q810M6 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Liat1Q810M6 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Liat1Q810M6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Liat1Q810M6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Liat1Q810M6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Liat1Q810M6 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Liat1Q810M6 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Liat1Q810M6 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Liat1Q810M6 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Liat1Q810M6 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Liat1Q810M6 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Liat1Q810M6 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Liat1Q810M6 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Liat1Q810M6 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Liat1Q810M6 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Liat1Q810M6 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Liat1Q810M6 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Liat1Q810M6 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Liat1Q810M6 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Liat1Q810M6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Liat1Q810M6 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Liat1Q810M6 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Liat1Q810M6 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Liat1Q810M6 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Liat1Q810M6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Liat1Q810M6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Liat1Q810M6 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Liat1Q810M6 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Liat1Q810M6 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Liat1Q810M6 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Liat1Q810M6 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Liat1Q810M6 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Liat1Q810M6 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Liat1Q810M6 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Liat1Q810M6 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Liat1Q810M6 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Liat1Q810M6 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Liat1Q810M6 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Liat1Q810M6 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Liat1Q810M6 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Liat1Q810M6 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Liat1Q810M6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Liat1Q810M6 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Liat1Q810M6 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Liat1Q810M6 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Liat1Q810M6 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Liat1Q810M6 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Liat1Q810M6 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Liat1Q810M6 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Liat1Q810M6 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Liat1Q810M6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Liat1Q810M6 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Liat1Q810M6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Liat1Q810M6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Liat1Q810M6 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Liat1Q810M6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Liat1Q810M6 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Liat1Q810M6 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Liat1Q810M6 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Liat1Q810M6 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Liat1Q810M6 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Liat1Q810M6 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Liat1Q810M6 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Liat1Q810M6 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Liat1Q810M6 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Liat1Q810M6 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Liat1Q810M6 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Liat1Q810M6 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Liat1Q810M6 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Liat1Q810M6 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Liat1Q810M6 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Liat1Q810M6 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Liat1Q810M6 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Liat1Q810M6 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Liat1Q810M6 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Liat1Q810M6 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Liat1Q810M6 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms