Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZD8

Amigo1, Amphoterin-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo1Q80ZD8 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Amigo1Q80ZD8 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Amigo1Q80ZD8 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Amigo1Q80ZD8 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Amigo1Q80ZD8 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Amigo1Q80ZD8 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Amigo1Q80ZD8 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Amigo1Q80ZD8 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Amigo1Q80ZD8 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Amigo1Q80ZD8 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Amigo1Q80ZD8 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Amigo1Q80ZD8 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Amigo1Q80ZD8 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Amigo1Q80ZD8 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Amigo1Q80ZD8 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Amigo1Q80ZD8 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Amigo1Q80ZD8 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Amigo1Q80ZD8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Amigo1Q80ZD8 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Amigo1Q80ZD8 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Amigo1Q80ZD8 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Amigo1Q80ZD8 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Amigo1Q80ZD8 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Amigo1Q80ZD8 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Amigo1Q80ZD8 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Amigo1Q80ZD8 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Amigo1Q80ZD8 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Amigo1Q80ZD8 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Amigo1Q80ZD8 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Amigo1Q80ZD8 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Amigo1Q80ZD8 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Amigo1Q80ZD8 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Amigo1Q80ZD8 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Amigo1Q80ZD8 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Amigo1Q80ZD8 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Amigo1Q80ZD8 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Amigo1Q80ZD8 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Amigo1Q80ZD8 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Amigo1Q80ZD8 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Amigo1Q80ZD8 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Amigo1Q80ZD8 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Amigo1Q80ZD8 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Amigo1Q80ZD8 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Amigo1Q80ZD8 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Amigo1Q80ZD8 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Amigo1Q80ZD8 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Amigo1Q80ZD8 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Amigo1Q80ZD8 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Amigo1Q80ZD8 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Amigo1Q80ZD8 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Amigo1Q80ZD8 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Amigo1Q80ZD8 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Amigo1Q80ZD8 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
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Amigo1Q80ZD8 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Amigo1Q80ZD8 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Amigo1Q80ZD8 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Amigo1Q80ZD8 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Amigo1Q80ZD8 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Amigo1Q80ZD8 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Amigo1Q80ZD8 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Amigo1Q80ZD8 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Amigo1Q80ZD8 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Amigo1Q80ZD8 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Amigo1Q80ZD8 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Amigo1Q80ZD8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Amigo1Q80ZD8 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Amigo1Q80ZD8 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Amigo1Q80ZD8 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Amigo1Q80ZD8 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Amigo1Q80ZD8 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Amigo1Q80ZD8 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Amigo1Q80ZD8 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Amigo1Q80ZD8 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Amigo1Q80ZD8 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Amigo1Q80ZD8 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Amigo1Q80ZD8 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Amigo1Q80ZD8 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Amigo1Q80ZD8 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Amigo1Q80ZD8 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Amigo1Q80ZD8 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Amigo1Q80ZD8 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms