Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lrrc1Q80VQ1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lrrc1Q80VQ1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lrrc1Q80VQ1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lrrc1Q80VQ1 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lrrc1Q80VQ1 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lrrc1Q80VQ1 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lrrc1Q80VQ1 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lrrc1Q80VQ1 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lrrc1Q80VQ1 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lrrc1Q80VQ1 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lrrc1Q80VQ1 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lrrc1Q80VQ1 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrrc1Q80VQ1 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrrc1Q80VQ1 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrrc1Q80VQ1 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrrc1Q80VQ1 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrrc1Q80VQ1 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrrc1Q80VQ1 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrrc1Q80VQ1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrrc1Q80VQ1 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrrc1Q80VQ1 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrrc1Q80VQ1 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrrc1Q80VQ1 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrrc1Q80VQ1 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrrc1Q80VQ1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrrc1Q80VQ1 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrrc1Q80VQ1 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrrc1Q80VQ1 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrrc1Q80VQ1 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lrrc1Q80VQ1 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lrrc1Q80VQ1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lrrc1Q80VQ1 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lrrc1Q80VQ1 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lrrc1Q80VQ1 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lrrc1Q80VQ1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lrrc1Q80VQ1 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Lrrc1Q80VQ1 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lrrc1Q80VQ1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Lrrc1Q80VQ1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lrrc1Q80VQ1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lrrc1Q80VQ1 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lrrc1Q80VQ1 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lrrc1Q80VQ1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lrrc1Q80VQ1 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lrrc1Q80VQ1 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lrrc1Q80VQ1 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lrrc1Q80VQ1 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lrrc1Q80VQ1 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lrrc1Q80VQ1 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lrrc1Q80VQ1 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lrrc1Q80VQ1 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lrrc1Q80VQ1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Lrrc1Q80VQ1 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lrrc1Q80VQ1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lrrc1Q80VQ1 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Lrrc1Q80VQ1 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms