Protein–RNA interactions for Protein: Q80U93

Nup214, Nuclear pore complex protein Nup214, mousemouse

Predictions only

Length 2,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup214Q80U93 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup214Q80U93 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup214Q80U93 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup214Q80U93 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup214Q80U93 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup214Q80U93 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup214Q80U93 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup214Q80U93 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup214Q80U93 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup214Q80U93 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup214Q80U93 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup214Q80U93 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup214Q80U93 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup214Q80U93 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup214Q80U93 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup214Q80U93 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup214Q80U93 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup214Q80U93 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup214Q80U93 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup214Q80U93 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup214Q80U93 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup214Q80U93 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup214Q80U93 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup214Q80U93 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup214Q80U93 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup214Q80U93 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup214Q80U93 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup214Q80U93 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup214Q80U93 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup214Q80U93 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup214Q80U93 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup214Q80U93 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup214Q80U93 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup214Q80U93 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup214Q80U93 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup214Q80U93 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup214Q80U93 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup214Q80U93 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup214Q80U93 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup214Q80U93 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup214Q80U93 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup214Q80U93 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup214Q80U93 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup214Q80U93 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup214Q80U93 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup214Q80U93 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup214Q80U93 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup214Q80U93 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup214Q80U93 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup214Q80U93 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup214Q80U93 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup214Q80U93 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup214Q80U93 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup214Q80U93 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup214Q80U93 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup214Q80U93 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup214Q80U93 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup214Q80U93 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup214Q80U93 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup214Q80U93 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup214Q80U93 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup214Q80U93 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup214Q80U93 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup214Q80U93 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup214Q80U93 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup214Q80U93 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup214Q80U93 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup214Q80U93 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup214Q80U93 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup214Q80U93 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup214Q80U93 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup214Q80U93 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup214Q80U93 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup214Q80U93 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup214Q80U93 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup214Q80U93 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup214Q80U93 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup214Q80U93 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup214Q80U93 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup214Q80U93 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nup214Q80U93 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nup214Q80U93 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nup214Q80U93 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nup214Q80U93 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nup214Q80U93 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nup214Q80U93 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nup214Q80U93 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nup214Q80U93 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nup214Q80U93 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nup214Q80U93 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nup214Q80U93 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nup214Q80U93 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nup214Q80U93 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nup214Q80U93 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nup214Q80U93 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nup214Q80U93 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nup214Q80U93 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nup214Q80U93 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nup214Q80U93 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nup214Q80U93 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms