Protein–RNA interactions for Protein: Q80U57

Rims3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims3Q80U57 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rims3Q80U57 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rims3Q80U57 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rims3Q80U57 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rims3Q80U57 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rims3Q80U57 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rims3Q80U57 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rims3Q80U57 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rims3Q80U57 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rims3Q80U57 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rims3Q80U57 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rims3Q80U57 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rims3Q80U57 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rims3Q80U57 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rims3Q80U57 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rims3Q80U57 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rims3Q80U57 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rims3Q80U57 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rims3Q80U57 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rims3Q80U57 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rims3Q80U57 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rims3Q80U57 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rims3Q80U57 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rims3Q80U57 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rims3Q80U57 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rims3Q80U57 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rims3Q80U57 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rims3Q80U57 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rims3Q80U57 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rims3Q80U57 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rims3Q80U57 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rims3Q80U57 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rims3Q80U57 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rims3Q80U57 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rims3Q80U57 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rims3Q80U57 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rims3Q80U57 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rims3Q80U57 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rims3Q80U57 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rims3Q80U57 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rims3Q80U57 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rims3Q80U57 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rims3Q80U57 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rims3Q80U57 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rims3Q80U57 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rims3Q80U57 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rims3Q80U57 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rims3Q80U57 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rims3Q80U57 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rims3Q80U57 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rims3Q80U57 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rims3Q80U57 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rims3Q80U57 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rims3Q80U57 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rims3Q80U57 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rims3Q80U57 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rims3Q80U57 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rims3Q80U57 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rims3Q80U57 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rims3Q80U57 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rims3Q80U57 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rims3Q80U57 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rims3Q80U57 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rims3Q80U57 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rims3Q80U57 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rims3Q80U57 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rims3Q80U57 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rims3Q80U57 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rims3Q80U57 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rims3Q80U57 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rims3Q80U57 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rims3Q80U57 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rims3Q80U57 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rims3Q80U57 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rims3Q80U57 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rims3Q80U57 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rims3Q80U57 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rims3Q80U57 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rims3Q80U57 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rims3Q80U57 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rims3Q80U57 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rims3Q80U57 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rims3Q80U57 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rims3Q80U57 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rims3Q80U57 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rims3Q80U57 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rims3Q80U57 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rims3Q80U57 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rims3Q80U57 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rims3Q80U57 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rims3Q80U57 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rims3Q80U57 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rims3Q80U57 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rims3Q80U57 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rims3Q80U57 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rims3Q80U57 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rims3Q80U57 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rims3Q80U57 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rims3Q80U57 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rims3Q80U57 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms