Protein–RNA interactions for Protein: Q80U35

Arhgef17, Rho guanine nucleotide exchange factor 17, mousemouse

Predictions only

Length 2,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef17Q80U35 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Arhgef17Q80U35 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Arhgef17Q80U35 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Arhgef17Q80U35 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Arhgef17Q80U35 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Arhgef17Q80U35 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Arhgef17Q80U35 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Arhgef17Q80U35 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Arhgef17Q80U35 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Arhgef17Q80U35 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Arhgef17Q80U35 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Arhgef17Q80U35 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Arhgef17Q80U35 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Arhgef17Q80U35 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Arhgef17Q80U35 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Arhgef17Q80U35 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Arhgef17Q80U35 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Arhgef17Q80U35 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Arhgef17Q80U35 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Arhgef17Q80U35 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Arhgef17Q80U35 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Arhgef17Q80U35 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Arhgef17Q80U35 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Arhgef17Q80U35 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Arhgef17Q80U35 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Arhgef17Q80U35 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Arhgef17Q80U35 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Arhgef17Q80U35 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Arhgef17Q80U35 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Arhgef17Q80U35 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Arhgef17Q80U35 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Arhgef17Q80U35 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Arhgef17Q80U35 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Arhgef17Q80U35 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Arhgef17Q80U35 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Arhgef17Q80U35 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Arhgef17Q80U35 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Arhgef17Q80U35 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Arhgef17Q80U35 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Arhgef17Q80U35 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Arhgef17Q80U35 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Arhgef17Q80U35 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Arhgef17Q80U35 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Arhgef17Q80U35 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Arhgef17Q80U35 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Arhgef17Q80U35 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Arhgef17Q80U35 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Arhgef17Q80U35 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Arhgef17Q80U35 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Arhgef17Q80U35 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Arhgef17Q80U35 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Arhgef17Q80U35 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Arhgef17Q80U35 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Arhgef17Q80U35 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Arhgef17Q80U35 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Arhgef17Q80U35 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Arhgef17Q80U35 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Arhgef17Q80U35 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Arhgef17Q80U35 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Arhgef17Q80U35 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Arhgef17Q80U35 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Arhgef17Q80U35 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Arhgef17Q80U35 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Arhgef17Q80U35 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Arhgef17Q80U35 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Arhgef17Q80U35 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Arhgef17Q80U35 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Arhgef17Q80U35 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Arhgef17Q80U35 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Arhgef17Q80U35 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Arhgef17Q80U35 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Arhgef17Q80U35 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Arhgef17Q80U35 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Arhgef17Q80U35 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Arhgef17Q80U35 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Arhgef17Q80U35 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Arhgef17Q80U35 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Arhgef17Q80U35 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Arhgef17Q80U35 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Arhgef17Q80U35 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Arhgef17Q80U35 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Arhgef17Q80U35 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Arhgef17Q80U35 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Arhgef17Q80U35 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Arhgef17Q80U35 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Arhgef17Q80U35 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Arhgef17Q80U35 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Arhgef17Q80U35 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Arhgef17Q80U35 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Arhgef17Q80U35 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Arhgef17Q80U35 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Arhgef17Q80U35 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Arhgef17Q80U35 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Arhgef17Q80U35 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Arhgef17Q80U35 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Arhgef17Q80U35 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Arhgef17Q80U35 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Arhgef17Q80U35 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Arhgef17Q80U35 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Arhgef17Q80U35 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms