Protein–RNA interactions for Protein: Q7TST5

Lamp3, Lysosome-associated membrane glycoprotein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp3Q7TST5 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lamp3Q7TST5 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lamp3Q7TST5 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lamp3Q7TST5 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lamp3Q7TST5 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lamp3Q7TST5 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lamp3Q7TST5 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lamp3Q7TST5 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lamp3Q7TST5 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lamp3Q7TST5 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lamp3Q7TST5 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lamp3Q7TST5 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lamp3Q7TST5 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lamp3Q7TST5 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lamp3Q7TST5 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lamp3Q7TST5 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lamp3Q7TST5 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lamp3Q7TST5 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lamp3Q7TST5 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lamp3Q7TST5 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lamp3Q7TST5 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lamp3Q7TST5 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lamp3Q7TST5 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lamp3Q7TST5 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lamp3Q7TST5 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lamp3Q7TST5 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lamp3Q7TST5 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lamp3Q7TST5 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lamp3Q7TST5 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lamp3Q7TST5 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lamp3Q7TST5 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lamp3Q7TST5 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lamp3Q7TST5 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lamp3Q7TST5 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lamp3Q7TST5 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lamp3Q7TST5 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lamp3Q7TST5 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lamp3Q7TST5 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lamp3Q7TST5 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lamp3Q7TST5 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lamp3Q7TST5 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lamp3Q7TST5 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lamp3Q7TST5 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lamp3Q7TST5 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lamp3Q7TST5 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lamp3Q7TST5 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lamp3Q7TST5 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lamp3Q7TST5 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lamp3Q7TST5 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lamp3Q7TST5 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lamp3Q7TST5 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lamp3Q7TST5 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lamp3Q7TST5 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lamp3Q7TST5 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lamp3Q7TST5 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lamp3Q7TST5 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lamp3Q7TST5 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lamp3Q7TST5 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lamp3Q7TST5 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lamp3Q7TST5 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lamp3Q7TST5 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lamp3Q7TST5 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lamp3Q7TST5 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lamp3Q7TST5 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lamp3Q7TST5 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lamp3Q7TST5 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lamp3Q7TST5 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lamp3Q7TST5 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lamp3Q7TST5 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lamp3Q7TST5 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lamp3Q7TST5 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lamp3Q7TST5 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lamp3Q7TST5 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lamp3Q7TST5 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lamp3Q7TST5 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lamp3Q7TST5 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lamp3Q7TST5 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lamp3Q7TST5 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lamp3Q7TST5 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lamp3Q7TST5 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lamp3Q7TST5 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lamp3Q7TST5 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lamp3Q7TST5 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lamp3Q7TST5 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lamp3Q7TST5 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lamp3Q7TST5 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lamp3Q7TST5 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lamp3Q7TST5 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lamp3Q7TST5 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lamp3Q7TST5 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lamp3Q7TST5 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lamp3Q7TST5 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lamp3Q7TST5 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lamp3Q7TST5 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lamp3Q7TST5 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lamp3Q7TST5 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lamp3Q7TST5 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lamp3Q7TST5 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lamp3Q7TST5 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lamp3Q7TST5 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms