Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
ClmQ7TSN2 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ClmQ7TSN2 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ClmQ7TSN2 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ClmQ7TSN2 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ClmQ7TSN2 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ClmQ7TSN2 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ClmQ7TSN2 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ClmQ7TSN2 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ClmQ7TSN2 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ClmQ7TSN2 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ClmQ7TSN2 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ClmQ7TSN2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ClmQ7TSN2 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ClmQ7TSN2 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ClmQ7TSN2 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ClmQ7TSN2 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ClmQ7TSN2 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ClmQ7TSN2 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClmQ7TSN2 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClmQ7TSN2 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClmQ7TSN2 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ClmQ7TSN2 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClmQ7TSN2 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClmQ7TSN2 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClmQ7TSN2 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
ClmQ7TSN2 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClmQ7TSN2 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ClmQ7TSN2 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClmQ7TSN2 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ClmQ7TSN2 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClmQ7TSN2 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ClmQ7TSN2 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ClmQ7TSN2 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClmQ7TSN2 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClmQ7TSN2 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ClmQ7TSN2 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ClmQ7TSN2 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClmQ7TSN2 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClmQ7TSN2 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClmQ7TSN2 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClmQ7TSN2 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClmQ7TSN2 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClmQ7TSN2 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ClmQ7TSN2 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ClmQ7TSN2 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClmQ7TSN2 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ClmQ7TSN2 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClmQ7TSN2 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ClmQ7TSN2 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ClmQ7TSN2 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClmQ7TSN2 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ClmQ7TSN2 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClmQ7TSN2 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ClmQ7TSN2 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClmQ7TSN2 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ClmQ7TSN2 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ClmQ7TSN2 Gm7430-201ENSMUST00000193824 1144 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ClmQ7TSN2 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClmQ7TSN2 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ClmQ7TSN2 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ClmQ7TSN2 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClmQ7TSN2 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClmQ7TSN2 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ClmQ7TSN2 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClmQ7TSN2 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClmQ7TSN2 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClmQ7TSN2 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClmQ7TSN2 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ClmQ7TSN2 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClmQ7TSN2 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms