Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dsg1bQ7TSF1 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Dsg1bQ7TSF1 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dsg1bQ7TSF1 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dsg1bQ7TSF1 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Dsg1bQ7TSF1 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dsg1bQ7TSF1 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dsg1bQ7TSF1 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dsg1bQ7TSF1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dsg1bQ7TSF1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dsg1bQ7TSF1 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dsg1bQ7TSF1 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dsg1bQ7TSF1 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dsg1bQ7TSF1 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dsg1bQ7TSF1 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dsg1bQ7TSF1 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Dsg1bQ7TSF1 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Dsg1bQ7TSF1 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dsg1bQ7TSF1 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dsg1bQ7TSF1 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dsg1bQ7TSF1 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dsg1bQ7TSF1 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dsg1bQ7TSF1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dsg1bQ7TSF1 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dsg1bQ7TSF1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dsg1bQ7TSF1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dsg1bQ7TSF1 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dsg1bQ7TSF1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dsg1bQ7TSF1 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dsg1bQ7TSF1 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dsg1bQ7TSF1 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Dsg1bQ7TSF1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dsg1bQ7TSF1 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dsg1bQ7TSF1 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dsg1bQ7TSF1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dsg1bQ7TSF1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dsg1bQ7TSF1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dsg1bQ7TSF1 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dsg1bQ7TSF1 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dsg1bQ7TSF1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dsg1bQ7TSF1 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dsg1bQ7TSF1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dsg1bQ7TSF1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dsg1bQ7TSF1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dsg1bQ7TSF1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dsg1bQ7TSF1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dsg1bQ7TSF1 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dsg1bQ7TSF1 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dsg1bQ7TSF1 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dsg1bQ7TSF1 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dsg1bQ7TSF1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dsg1bQ7TSF1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dsg1bQ7TSF1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dsg1bQ7TSF1 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dsg1bQ7TSF1 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dsg1bQ7TSF1 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dsg1bQ7TSF1 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dsg1bQ7TSF1 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Dsg1bQ7TSF1 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dsg1bQ7TSF1 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dsg1bQ7TSF1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dsg1bQ7TSF1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dsg1bQ7TSF1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dsg1bQ7TSF1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dsg1bQ7TSF1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dsg1bQ7TSF1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dsg1bQ7TSF1 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dsg1bQ7TSF1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dsg1bQ7TSF1 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dsg1bQ7TSF1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dsg1bQ7TSF1 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dsg1bQ7TSF1 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dsg1bQ7TSF1 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dsg1bQ7TSF1 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dsg1bQ7TSF1 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dsg1bQ7TSF1 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dsg1bQ7TSF1 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dsg1bQ7TSF1 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms