Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQK4

Exosc3, Exosome complex component RRP40, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc3Q7TQK4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Exosc3Q7TQK4 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Exosc3Q7TQK4 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Exosc3Q7TQK4 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Exosc3Q7TQK4 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Exosc3Q7TQK4 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Exosc3Q7TQK4 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Exosc3Q7TQK4 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Exosc3Q7TQK4 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Exosc3Q7TQK4 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Exosc3Q7TQK4 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Exosc3Q7TQK4 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Exosc3Q7TQK4 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Exosc3Q7TQK4 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Exosc3Q7TQK4 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Exosc3Q7TQK4 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Exosc3Q7TQK4 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Exosc3Q7TQK4 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Exosc3Q7TQK4 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Exosc3Q7TQK4 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Exosc3Q7TQK4 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Exosc3Q7TQK4 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Exosc3Q7TQK4 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Exosc3Q7TQK4 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Exosc3Q7TQK4 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Exosc3Q7TQK4 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Exosc3Q7TQK4 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Exosc3Q7TQK4 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Exosc3Q7TQK4 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Exosc3Q7TQK4 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Exosc3Q7TQK4 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Exosc3Q7TQK4 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Exosc3Q7TQK4 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Exosc3Q7TQK4 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Exosc3Q7TQK4 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Exosc3Q7TQK4 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Exosc3Q7TQK4 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Exosc3Q7TQK4 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Exosc3Q7TQK4 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Exosc3Q7TQK4 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Exosc3Q7TQK4 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Exosc3Q7TQK4 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Exosc3Q7TQK4 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Exosc3Q7TQK4 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Exosc3Q7TQK4 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Exosc3Q7TQK4 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Exosc3Q7TQK4 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Exosc3Q7TQK4 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Exosc3Q7TQK4 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Exosc3Q7TQK4 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Exosc3Q7TQK4 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Exosc3Q7TQK4 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Exosc3Q7TQK4 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Exosc3Q7TQK4 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Exosc3Q7TQK4 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Exosc3Q7TQK4 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Exosc3Q7TQK4 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Exosc3Q7TQK4 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Exosc3Q7TQK4 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Exosc3Q7TQK4 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Exosc3Q7TQK4 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Exosc3Q7TQK4 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Exosc3Q7TQK4 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Exosc3Q7TQK4 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Exosc3Q7TQK4 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Exosc3Q7TQK4 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Exosc3Q7TQK4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Exosc3Q7TQK4 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Exosc3Q7TQK4 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Exosc3Q7TQK4 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Exosc3Q7TQK4 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Exosc3Q7TQK4 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Exosc3Q7TQK4 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Exosc3Q7TQK4 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Exosc3Q7TQK4 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Exosc3Q7TQK4 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Exosc3Q7TQK4 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Exosc3Q7TQK4 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Exosc3Q7TQK4 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Exosc3Q7TQK4 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Exosc3Q7TQK4 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Exosc3Q7TQK4 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Exosc3Q7TQK4 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Exosc3Q7TQK4 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Exosc3Q7TQK4 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Exosc3Q7TQK4 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Exosc3Q7TQK4 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Exosc3Q7TQK4 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Exosc3Q7TQK4 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Exosc3Q7TQK4 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Exosc3Q7TQK4 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Exosc3Q7TQK4 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Exosc3Q7TQK4 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Exosc3Q7TQK4 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Exosc3Q7TQK4 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Exosc3Q7TQK4 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Exosc3Q7TQK4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Exosc3Q7TQK4 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Exosc3Q7TQK4 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Exosc3Q7TQK4 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms