Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Actn1Q7TPR4 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Actn1Q7TPR4 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Actn1Q7TPR4 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Actn1Q7TPR4 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Actn1Q7TPR4 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Actn1Q7TPR4 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Actn1Q7TPR4 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Actn1Q7TPR4 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Actn1Q7TPR4 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Actn1Q7TPR4 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Actn1Q7TPR4 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Actn1Q7TPR4 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Actn1Q7TPR4 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Actn1Q7TPR4 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Actn1Q7TPR4 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Actn1Q7TPR4 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Actn1Q7TPR4 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Actn1Q7TPR4 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Actn1Q7TPR4 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Actn1Q7TPR4 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Actn1Q7TPR4 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Actn1Q7TPR4 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Actn1Q7TPR4 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Actn1Q7TPR4 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Actn1Q7TPR4 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Actn1Q7TPR4 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Actn1Q7TPR4 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Actn1Q7TPR4 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Actn1Q7TPR4 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Actn1Q7TPR4 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Actn1Q7TPR4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Actn1Q7TPR4 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Actn1Q7TPR4 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Actn1Q7TPR4 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Actn1Q7TPR4 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Actn1Q7TPR4 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Actn1Q7TPR4 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Actn1Q7TPR4 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Actn1Q7TPR4 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Actn1Q7TPR4 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Actn1Q7TPR4 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Actn1Q7TPR4 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Actn1Q7TPR4 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Actn1Q7TPR4 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Actn1Q7TPR4 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Actn1Q7TPR4 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Actn1Q7TPR4 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Actn1Q7TPR4 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Actn1Q7TPR4 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Actn1Q7TPR4 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Actn1Q7TPR4 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Actn1Q7TPR4 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Actn1Q7TPR4 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Actn1Q7TPR4 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Actn1Q7TPR4 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Actn1Q7TPR4 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Actn1Q7TPR4 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Actn1Q7TPR4 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Actn1Q7TPR4 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Actn1Q7TPR4 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Actn1Q7TPR4 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Actn1Q7TPR4 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Actn1Q7TPR4 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Actn1Q7TPR4 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Actn1Q7TPR4 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Actn1Q7TPR4 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Actn1Q7TPR4 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Actn1Q7TPR4 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Actn1Q7TPR4 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Actn1Q7TPR4 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Actn1Q7TPR4 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Actn1Q7TPR4 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Actn1Q7TPR4 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Actn1Q7TPR4 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Actn1Q7TPR4 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Actn1Q7TPR4 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Actn1Q7TPR4 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Actn1Q7TPR4 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Actn1Q7TPR4 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Actn1Q7TPR4 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Actn1Q7TPR4 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Actn1Q7TPR4 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Actn1Q7TPR4 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Actn1Q7TPR4 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Actn1Q7TPR4 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Actn1Q7TPR4 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Actn1Q7TPR4 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Actn1Q7TPR4 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Actn1Q7TPR4 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Actn1Q7TPR4 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Actn1Q7TPR4 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Actn1Q7TPR4 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Actn1Q7TPR4 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Actn1Q7TPR4 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Actn1Q7TPR4 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Actn1Q7TPR4 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Actn1Q7TPR4 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Actn1Q7TPR4 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Actn1Q7TPR4 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms