Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNL3

Stk40, Serine/threonine-protein kinase 40, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stk40Q7TNL3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stk40Q7TNL3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stk40Q7TNL3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stk40Q7TNL3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stk40Q7TNL3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stk40Q7TNL3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stk40Q7TNL3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stk40Q7TNL3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stk40Q7TNL3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stk40Q7TNL3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Stk40Q7TNL3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stk40Q7TNL3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stk40Q7TNL3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stk40Q7TNL3 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stk40Q7TNL3 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Stk40Q7TNL3 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Stk40Q7TNL3 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Stk40Q7TNL3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Stk40Q7TNL3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stk40Q7TNL3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stk40Q7TNL3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stk40Q7TNL3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stk40Q7TNL3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stk40Q7TNL3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stk40Q7TNL3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stk40Q7TNL3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stk40Q7TNL3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stk40Q7TNL3 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stk40Q7TNL3 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stk40Q7TNL3 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stk40Q7TNL3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stk40Q7TNL3 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stk40Q7TNL3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stk40Q7TNL3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stk40Q7TNL3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stk40Q7TNL3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stk40Q7TNL3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stk40Q7TNL3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stk40Q7TNL3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stk40Q7TNL3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stk40Q7TNL3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stk40Q7TNL3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stk40Q7TNL3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stk40Q7TNL3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stk40Q7TNL3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stk40Q7TNL3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stk40Q7TNL3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stk40Q7TNL3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stk40Q7TNL3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stk40Q7TNL3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stk40Q7TNL3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stk40Q7TNL3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stk40Q7TNL3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stk40Q7TNL3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stk40Q7TNL3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stk40Q7TNL3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stk40Q7TNL3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stk40Q7TNL3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Stk40Q7TNL3 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Stk40Q7TNL3 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Stk40Q7TNL3 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Stk40Q7TNL3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Stk40Q7TNL3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Stk40Q7TNL3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Stk40Q7TNL3 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Stk40Q7TNL3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Stk40Q7TNL3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Stk40Q7TNL3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Stk40Q7TNL3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Stk40Q7TNL3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Stk40Q7TNL3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Stk40Q7TNL3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Stk40Q7TNL3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Stk40Q7TNL3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Stk40Q7TNL3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Stk40Q7TNL3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Stk40Q7TNL3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Stk40Q7TNL3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Stk40Q7TNL3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Stk40Q7TNL3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Stk40Q7TNL3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Stk40Q7TNL3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stk40Q7TNL3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stk40Q7TNL3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stk40Q7TNL3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stk40Q7TNL3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stk40Q7TNL3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Stk40Q7TNL3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stk40Q7TNL3 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stk40Q7TNL3 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stk40Q7TNL3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stk40Q7TNL3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Stk40Q7TNL3 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Stk40Q7TNL3 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stk40Q7TNL3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stk40Q7TNL3 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stk40Q7TNL3 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stk40Q7TNL3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stk40Q7TNL3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stk40Q7TNL3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms