Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Shq1Q7TMX5 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Shq1Q7TMX5 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Shq1Q7TMX5 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Shq1Q7TMX5 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Shq1Q7TMX5 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Shq1Q7TMX5 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Shq1Q7TMX5 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Shq1Q7TMX5 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Shq1Q7TMX5 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Shq1Q7TMX5 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Shq1Q7TMX5 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Shq1Q7TMX5 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Shq1Q7TMX5 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Shq1Q7TMX5 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Shq1Q7TMX5 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Shq1Q7TMX5 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Shq1Q7TMX5 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Shq1Q7TMX5 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Shq1Q7TMX5 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Shq1Q7TMX5 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Shq1Q7TMX5 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Shq1Q7TMX5 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Shq1Q7TMX5 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Shq1Q7TMX5 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Shq1Q7TMX5 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Shq1Q7TMX5 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Shq1Q7TMX5 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Shq1Q7TMX5 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Shq1Q7TMX5 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Shq1Q7TMX5 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Shq1Q7TMX5 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Shq1Q7TMX5 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Shq1Q7TMX5 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Shq1Q7TMX5 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Shq1Q7TMX5 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Shq1Q7TMX5 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Shq1Q7TMX5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Shq1Q7TMX5 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Shq1Q7TMX5 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Shq1Q7TMX5 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Shq1Q7TMX5 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Shq1Q7TMX5 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Shq1Q7TMX5 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Shq1Q7TMX5 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Shq1Q7TMX5 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Shq1Q7TMX5 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Shq1Q7TMX5 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Shq1Q7TMX5 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Shq1Q7TMX5 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Shq1Q7TMX5 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Shq1Q7TMX5 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Shq1Q7TMX5 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Shq1Q7TMX5 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Shq1Q7TMX5 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Shq1Q7TMX5 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Shq1Q7TMX5 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Shq1Q7TMX5 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Shq1Q7TMX5 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Shq1Q7TMX5 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Shq1Q7TMX5 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Shq1Q7TMX5 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Shq1Q7TMX5 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Shq1Q7TMX5 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Shq1Q7TMX5 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Shq1Q7TMX5 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Shq1Q7TMX5 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Shq1Q7TMX5 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Shq1Q7TMX5 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Shq1Q7TMX5 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Shq1Q7TMX5 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Shq1Q7TMX5 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Shq1Q7TMX5 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Shq1Q7TMX5 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Shq1Q7TMX5 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Shq1Q7TMX5 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Shq1Q7TMX5 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Shq1Q7TMX5 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Shq1Q7TMX5 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Shq1Q7TMX5 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Shq1Q7TMX5 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Shq1Q7TMX5 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Shq1Q7TMX5 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Shq1Q7TMX5 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Shq1Q7TMX5 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Shq1Q7TMX5 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Shq1Q7TMX5 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Shq1Q7TMX5 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Shq1Q7TMX5 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Shq1Q7TMX5 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Shq1Q7TMX5 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Shq1Q7TMX5 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Shq1Q7TMX5 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Shq1Q7TMX5 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Shq1Q7TMX5 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Shq1Q7TMX5 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Shq1Q7TMX5 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Shq1Q7TMX5 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Shq1Q7TMX5 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Shq1Q7TMX5 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms