Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TwistnbQ78WZ7 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TwistnbQ78WZ7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TwistnbQ78WZ7 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TwistnbQ78WZ7 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TwistnbQ78WZ7 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TwistnbQ78WZ7 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TwistnbQ78WZ7 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TwistnbQ78WZ7 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TwistnbQ78WZ7 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TwistnbQ78WZ7 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TwistnbQ78WZ7 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TwistnbQ78WZ7 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TwistnbQ78WZ7 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TwistnbQ78WZ7 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TwistnbQ78WZ7 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TwistnbQ78WZ7 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TwistnbQ78WZ7 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TwistnbQ78WZ7 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TwistnbQ78WZ7 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TwistnbQ78WZ7 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TwistnbQ78WZ7 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TwistnbQ78WZ7 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TwistnbQ78WZ7 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TwistnbQ78WZ7 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TwistnbQ78WZ7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TwistnbQ78WZ7 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TwistnbQ78WZ7 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TwistnbQ78WZ7 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TwistnbQ78WZ7 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TwistnbQ78WZ7 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TwistnbQ78WZ7 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TwistnbQ78WZ7 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TwistnbQ78WZ7 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TwistnbQ78WZ7 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TwistnbQ78WZ7 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TwistnbQ78WZ7 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TwistnbQ78WZ7 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TwistnbQ78WZ7 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TwistnbQ78WZ7 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TwistnbQ78WZ7 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TwistnbQ78WZ7 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TwistnbQ78WZ7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TwistnbQ78WZ7 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TwistnbQ78WZ7 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TwistnbQ78WZ7 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TwistnbQ78WZ7 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TwistnbQ78WZ7 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TwistnbQ78WZ7 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TwistnbQ78WZ7 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TwistnbQ78WZ7 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TwistnbQ78WZ7 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TwistnbQ78WZ7 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TwistnbQ78WZ7 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TwistnbQ78WZ7 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TwistnbQ78WZ7 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TwistnbQ78WZ7 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TwistnbQ78WZ7 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TwistnbQ78WZ7 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TwistnbQ78WZ7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TwistnbQ78WZ7 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TwistnbQ78WZ7 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TwistnbQ78WZ7 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TwistnbQ78WZ7 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TwistnbQ78WZ7 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TwistnbQ78WZ7 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TwistnbQ78WZ7 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TwistnbQ78WZ7 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TwistnbQ78WZ7 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TwistnbQ78WZ7 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TwistnbQ78WZ7 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TwistnbQ78WZ7 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TwistnbQ78WZ7 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TwistnbQ78WZ7 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TwistnbQ78WZ7 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TwistnbQ78WZ7 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TwistnbQ78WZ7 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TwistnbQ78WZ7 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TwistnbQ78WZ7 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TwistnbQ78WZ7 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TwistnbQ78WZ7 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TwistnbQ78WZ7 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TwistnbQ78WZ7 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TwistnbQ78WZ7 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TwistnbQ78WZ7 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TwistnbQ78WZ7 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TwistnbQ78WZ7 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TwistnbQ78WZ7 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TwistnbQ78WZ7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TwistnbQ78WZ7 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TwistnbQ78WZ7 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TwistnbQ78WZ7 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TwistnbQ78WZ7 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TwistnbQ78WZ7 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TwistnbQ78WZ7 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TwistnbQ78WZ7 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TwistnbQ78WZ7 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TwistnbQ78WZ7 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TwistnbQ78WZ7 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TwistnbQ78WZ7 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms