Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWY6

Ube2d2b, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D2B, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d2bQ6ZWY6 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ube2d2bQ6ZWY6 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ube2d2bQ6ZWY6 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ube2d2bQ6ZWY6 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ube2d2bQ6ZWY6 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ube2d2bQ6ZWY6 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ube2d2bQ6ZWY6 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ube2d2bQ6ZWY6 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ube2d2bQ6ZWY6 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ube2d2bQ6ZWY6 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ube2d2bQ6ZWY6 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ube2d2bQ6ZWY6 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ube2d2bQ6ZWY6 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ube2d2bQ6ZWY6 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ube2d2bQ6ZWY6 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ube2d2bQ6ZWY6 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ube2d2bQ6ZWY6 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ube2d2bQ6ZWY6 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ube2d2bQ6ZWY6 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ube2d2bQ6ZWY6 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ube2d2bQ6ZWY6 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ube2d2bQ6ZWY6 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ube2d2bQ6ZWY6 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ube2d2bQ6ZWY6 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ube2d2bQ6ZWY6 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ube2d2bQ6ZWY6 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ube2d2bQ6ZWY6 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ube2d2bQ6ZWY6 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ube2d2bQ6ZWY6 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ube2d2bQ6ZWY6 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ube2d2bQ6ZWY6 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ube2d2bQ6ZWY6 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ube2d2bQ6ZWY6 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ube2d2bQ6ZWY6 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ube2d2bQ6ZWY6 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ube2d2bQ6ZWY6 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ube2d2bQ6ZWY6 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ube2d2bQ6ZWY6 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ube2d2bQ6ZWY6 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ube2d2bQ6ZWY6 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ube2d2bQ6ZWY6 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ube2d2bQ6ZWY6 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ube2d2bQ6ZWY6 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms