Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS8

Spop, Speckle-type POZ protein, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpopQ6ZWS8 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SpopQ6ZWS8 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SpopQ6ZWS8 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SpopQ6ZWS8 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SpopQ6ZWS8 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SpopQ6ZWS8 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SpopQ6ZWS8 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SpopQ6ZWS8 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SpopQ6ZWS8 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SpopQ6ZWS8 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SpopQ6ZWS8 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SpopQ6ZWS8 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SpopQ6ZWS8 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SpopQ6ZWS8 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SpopQ6ZWS8 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SpopQ6ZWS8 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SpopQ6ZWS8 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SpopQ6ZWS8 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SpopQ6ZWS8 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SpopQ6ZWS8 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SpopQ6ZWS8 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SpopQ6ZWS8 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SpopQ6ZWS8 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SpopQ6ZWS8 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SpopQ6ZWS8 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SpopQ6ZWS8 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SpopQ6ZWS8 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SpopQ6ZWS8 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SpopQ6ZWS8 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SpopQ6ZWS8 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SpopQ6ZWS8 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SpopQ6ZWS8 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SpopQ6ZWS8 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SpopQ6ZWS8 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SpopQ6ZWS8 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SpopQ6ZWS8 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SpopQ6ZWS8 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SpopQ6ZWS8 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SpopQ6ZWS8 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SpopQ6ZWS8 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SpopQ6ZWS8 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SpopQ6ZWS8 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SpopQ6ZWS8 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SpopQ6ZWS8 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SpopQ6ZWS8 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SpopQ6ZWS8 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SpopQ6ZWS8 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SpopQ6ZWS8 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SpopQ6ZWS8 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SpopQ6ZWS8 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SpopQ6ZWS8 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SpopQ6ZWS8 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SpopQ6ZWS8 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SpopQ6ZWS8 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SpopQ6ZWS8 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SpopQ6ZWS8 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SpopQ6ZWS8 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SpopQ6ZWS8 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SpopQ6ZWS8 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SpopQ6ZWS8 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SpopQ6ZWS8 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SpopQ6ZWS8 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SpopQ6ZWS8 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SpopQ6ZWS8 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SpopQ6ZWS8 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SpopQ6ZWS8 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SpopQ6ZWS8 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SpopQ6ZWS8 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SpopQ6ZWS8 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SpopQ6ZWS8 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SpopQ6ZWS8 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SpopQ6ZWS8 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SpopQ6ZWS8 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SpopQ6ZWS8 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SpopQ6ZWS8 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SpopQ6ZWS8 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SpopQ6ZWS8 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SpopQ6ZWS8 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SpopQ6ZWS8 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SpopQ6ZWS8 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SpopQ6ZWS8 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SpopQ6ZWS8 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SpopQ6ZWS8 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SpopQ6ZWS8 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SpopQ6ZWS8 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SpopQ6ZWS8 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SpopQ6ZWS8 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SpopQ6ZWS8 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SpopQ6ZWS8 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SpopQ6ZWS8 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SpopQ6ZWS8 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SpopQ6ZWS8 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SpopQ6ZWS8 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SpopQ6ZWS8 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SpopQ6ZWS8 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SpopQ6ZWS8 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SpopQ6ZWS8 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SpopQ6ZWS8 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SpopQ6ZWS8 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SpopQ6ZWS8 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms