Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQL4

Wdr43, WD repeat-containing protein 43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 677 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr43Q6ZQL4 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Wdr43Q6ZQL4 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Wdr43Q6ZQL4 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Wdr43Q6ZQL4 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Wdr43Q6ZQL4 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Wdr43Q6ZQL4 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Wdr43Q6ZQL4 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Wdr43Q6ZQL4 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Wdr43Q6ZQL4 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Wdr43Q6ZQL4 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Wdr43Q6ZQL4 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Wdr43Q6ZQL4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Wdr43Q6ZQL4 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Wdr43Q6ZQL4 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Wdr43Q6ZQL4 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Wdr43Q6ZQL4 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Wdr43Q6ZQL4 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Wdr43Q6ZQL4 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Wdr43Q6ZQL4 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Wdr43Q6ZQL4 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Wdr43Q6ZQL4 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Wdr43Q6ZQL4 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Wdr43Q6ZQL4 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Wdr43Q6ZQL4 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Wdr43Q6ZQL4 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Wdr43Q6ZQL4 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Wdr43Q6ZQL4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Wdr43Q6ZQL4 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Wdr43Q6ZQL4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Wdr43Q6ZQL4 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Wdr43Q6ZQL4 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Wdr43Q6ZQL4 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Wdr43Q6ZQL4 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Wdr43Q6ZQL4 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Wdr43Q6ZQL4 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Wdr43Q6ZQL4 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Wdr43Q6ZQL4 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Wdr43Q6ZQL4 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Wdr43Q6ZQL4 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Wdr43Q6ZQL4 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Wdr43Q6ZQL4 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Wdr43Q6ZQL4 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Wdr43Q6ZQL4 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Wdr43Q6ZQL4 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Wdr43Q6ZQL4 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Wdr43Q6ZQL4 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Wdr43Q6ZQL4 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Wdr43Q6ZQL4 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Wdr43Q6ZQL4 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Wdr43Q6ZQL4 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Wdr43Q6ZQL4 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Wdr43Q6ZQL4 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Wdr43Q6ZQL4 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Wdr43Q6ZQL4 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Wdr43Q6ZQL4 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Wdr43Q6ZQL4 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Wdr43Q6ZQL4 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Wdr43Q6ZQL4 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Wdr43Q6ZQL4 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Wdr43Q6ZQL4 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Wdr43Q6ZQL4 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Wdr43Q6ZQL4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Wdr43Q6ZQL4 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Wdr43Q6ZQL4 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Wdr43Q6ZQL4 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Wdr43Q6ZQL4 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Wdr43Q6ZQL4 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Wdr43Q6ZQL4 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Wdr43Q6ZQL4 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Wdr43Q6ZQL4 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Wdr43Q6ZQL4 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Wdr43Q6ZQL4 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Wdr43Q6ZQL4 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Wdr43Q6ZQL4 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Wdr43Q6ZQL4 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Wdr43Q6ZQL4 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Wdr43Q6ZQL4 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Wdr43Q6ZQL4 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Wdr43Q6ZQL4 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Wdr43Q6ZQL4 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Wdr43Q6ZQL4 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Wdr43Q6ZQL4 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Wdr43Q6ZQL4 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Wdr43Q6ZQL4 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Wdr43Q6ZQL4 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Wdr43Q6ZQL4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Wdr43Q6ZQL4 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Wdr43Q6ZQL4 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Wdr43Q6ZQL4 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Wdr43Q6ZQL4 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Wdr43Q6ZQL4 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Wdr43Q6ZQL4 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Wdr43Q6ZQL4 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Wdr43Q6ZQL4 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Wdr43Q6ZQL4 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Wdr43Q6ZQL4 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Wdr43Q6ZQL4 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Wdr43Q6ZQL4 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Wdr43Q6ZQL4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Wdr43Q6ZQL4 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms