Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ncapd3Q6ZQK0 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ncapd3Q6ZQK0 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ncapd3Q6ZQK0 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ncapd3Q6ZQK0 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ncapd3Q6ZQK0 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ncapd3Q6ZQK0 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ncapd3Q6ZQK0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ncapd3Q6ZQK0 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ncapd3Q6ZQK0 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ncapd3Q6ZQK0 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ncapd3Q6ZQK0 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ncapd3Q6ZQK0 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ncapd3Q6ZQK0 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ncapd3Q6ZQK0 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ncapd3Q6ZQK0 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ncapd3Q6ZQK0 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ncapd3Q6ZQK0 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ncapd3Q6ZQK0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ncapd3Q6ZQK0 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ncapd3Q6ZQK0 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ncapd3Q6ZQK0 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ncapd3Q6ZQK0 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ncapd3Q6ZQK0 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ncapd3Q6ZQK0 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ncapd3Q6ZQK0 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ncapd3Q6ZQK0 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ncapd3Q6ZQK0 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ncapd3Q6ZQK0 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ncapd3Q6ZQK0 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Ncapd3Q6ZQK0 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ncapd3Q6ZQK0 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ncapd3Q6ZQK0 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ncapd3Q6ZQK0 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ncapd3Q6ZQK0 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ncapd3Q6ZQK0 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Ncapd3Q6ZQK0 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ncapd3Q6ZQK0 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ncapd3Q6ZQK0 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ncapd3Q6ZQK0 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ncapd3Q6ZQK0 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ncapd3Q6ZQK0 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ncapd3Q6ZQK0 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ncapd3Q6ZQK0 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ncapd3Q6ZQK0 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ncapd3Q6ZQK0 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ncapd3Q6ZQK0 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ncapd3Q6ZQK0 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ncapd3Q6ZQK0 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ncapd3Q6ZQK0 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ncapd3Q6ZQK0 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ncapd3Q6ZQK0 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ncapd3Q6ZQK0 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
Ncapd3Q6ZQK0 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ncapd3Q6ZQK0 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ncapd3Q6ZQK0 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Ncapd3Q6ZQK0 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ncapd3Q6ZQK0 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ncapd3Q6ZQK0 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ncapd3Q6ZQK0 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ncapd3Q6ZQK0 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ncapd3Q6ZQK0 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ncapd3Q6ZQK0 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ncapd3Q6ZQK0 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ncapd3Q6ZQK0 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ncapd3Q6ZQK0 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ncapd3Q6ZQK0 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ncapd3Q6ZQK0 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Ncapd3Q6ZQK0 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ncapd3Q6ZQK0 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ncapd3Q6ZQK0 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ncapd3Q6ZQK0 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ncapd3Q6ZQK0 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ncapd3Q6ZQK0 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ncapd3Q6ZQK0 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ncapd3Q6ZQK0 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ncapd3Q6ZQK0 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ncapd3Q6ZQK0 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ncapd3Q6ZQK0 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ncapd3Q6ZQK0 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ncapd3Q6ZQK0 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ncapd3Q6ZQK0 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ncapd3Q6ZQK0 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ncapd3Q6ZQK0 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ncapd3Q6ZQK0 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ncapd3Q6ZQK0 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ncapd3Q6ZQK0 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ncapd3Q6ZQK0 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ncapd3Q6ZQK0 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Ncapd3Q6ZQK0 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ncapd3Q6ZQK0 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ncapd3Q6ZQK0 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ncapd3Q6ZQK0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ncapd3Q6ZQK0 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ncapd3Q6ZQK0 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ncapd3Q6ZQK0 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ncapd3Q6ZQK0 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Ncapd3Q6ZQK0 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ncapd3Q6ZQK0 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms