Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQE4

Nemp1, Nuclear envelope integral membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nemp1Q6ZQE4 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nemp1Q6ZQE4 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nemp1Q6ZQE4 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nemp1Q6ZQE4 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nemp1Q6ZQE4 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nemp1Q6ZQE4 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Nemp1Q6ZQE4 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nemp1Q6ZQE4 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nemp1Q6ZQE4 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nemp1Q6ZQE4 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nemp1Q6ZQE4 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Nemp1Q6ZQE4 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Nemp1Q6ZQE4 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nemp1Q6ZQE4 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nemp1Q6ZQE4 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nemp1Q6ZQE4 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nemp1Q6ZQE4 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nemp1Q6ZQE4 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nemp1Q6ZQE4 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nemp1Q6ZQE4 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nemp1Q6ZQE4 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nemp1Q6ZQE4 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nemp1Q6ZQE4 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nemp1Q6ZQE4 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nemp1Q6ZQE4 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nemp1Q6ZQE4 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nemp1Q6ZQE4 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nemp1Q6ZQE4 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nemp1Q6ZQE4 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nemp1Q6ZQE4 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nemp1Q6ZQE4 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nemp1Q6ZQE4 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nemp1Q6ZQE4 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nemp1Q6ZQE4 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nemp1Q6ZQE4 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nemp1Q6ZQE4 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nemp1Q6ZQE4 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nemp1Q6ZQE4 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Nemp1Q6ZQE4 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nemp1Q6ZQE4 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nemp1Q6ZQE4 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nemp1Q6ZQE4 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nemp1Q6ZQE4 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nemp1Q6ZQE4 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nemp1Q6ZQE4 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nemp1Q6ZQE4 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nemp1Q6ZQE4 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nemp1Q6ZQE4 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nemp1Q6ZQE4 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nemp1Q6ZQE4 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nemp1Q6ZQE4 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nemp1Q6ZQE4 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nemp1Q6ZQE4 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nemp1Q6ZQE4 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nemp1Q6ZQE4 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nemp1Q6ZQE4 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nemp1Q6ZQE4 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nemp1Q6ZQE4 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nemp1Q6ZQE4 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nemp1Q6ZQE4 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nemp1Q6ZQE4 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nemp1Q6ZQE4 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nemp1Q6ZQE4 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nemp1Q6ZQE4 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nemp1Q6ZQE4 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nemp1Q6ZQE4 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nemp1Q6ZQE4 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nemp1Q6ZQE4 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nemp1Q6ZQE4 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nemp1Q6ZQE4 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nemp1Q6ZQE4 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nemp1Q6ZQE4 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nemp1Q6ZQE4 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nemp1Q6ZQE4 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Nemp1Q6ZQE4 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Nemp1Q6ZQE4 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nemp1Q6ZQE4 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nemp1Q6ZQE4 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nemp1Q6ZQE4 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nemp1Q6ZQE4 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Nemp1Q6ZQE4 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nemp1Q6ZQE4 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nemp1Q6ZQE4 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nemp1Q6ZQE4 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nemp1Q6ZQE4 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nemp1Q6ZQE4 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nemp1Q6ZQE4 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nemp1Q6ZQE4 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nemp1Q6ZQE4 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nemp1Q6ZQE4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nemp1Q6ZQE4 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nemp1Q6ZQE4 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nemp1Q6ZQE4 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nemp1Q6ZQE4 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nemp1Q6ZQE4 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nemp1Q6ZQE4 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nemp1Q6ZQE4 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nemp1Q6ZQE4 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nemp1Q6ZQE4 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nemp1Q6ZQE4 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms