Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ12

Ninl, Ninein-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinlQ6ZQ12 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NinlQ6ZQ12 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NinlQ6ZQ12 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NinlQ6ZQ12 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NinlQ6ZQ12 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NinlQ6ZQ12 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NinlQ6ZQ12 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NinlQ6ZQ12 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NinlQ6ZQ12 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NinlQ6ZQ12 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NinlQ6ZQ12 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NinlQ6ZQ12 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NinlQ6ZQ12 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NinlQ6ZQ12 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NinlQ6ZQ12 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NinlQ6ZQ12 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NinlQ6ZQ12 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NinlQ6ZQ12 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NinlQ6ZQ12 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NinlQ6ZQ12 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NinlQ6ZQ12 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NinlQ6ZQ12 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NinlQ6ZQ12 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NinlQ6ZQ12 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NinlQ6ZQ12 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NinlQ6ZQ12 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NinlQ6ZQ12 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NinlQ6ZQ12 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NinlQ6ZQ12 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NinlQ6ZQ12 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NinlQ6ZQ12 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NinlQ6ZQ12 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NinlQ6ZQ12 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NinlQ6ZQ12 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NinlQ6ZQ12 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NinlQ6ZQ12 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NinlQ6ZQ12 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NinlQ6ZQ12 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NinlQ6ZQ12 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NinlQ6ZQ12 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NinlQ6ZQ12 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NinlQ6ZQ12 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NinlQ6ZQ12 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NinlQ6ZQ12 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NinlQ6ZQ12 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NinlQ6ZQ12 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NinlQ6ZQ12 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NinlQ6ZQ12 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NinlQ6ZQ12 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NinlQ6ZQ12 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NinlQ6ZQ12 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NinlQ6ZQ12 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NinlQ6ZQ12 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NinlQ6ZQ12 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NinlQ6ZQ12 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NinlQ6ZQ12 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NinlQ6ZQ12 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NinlQ6ZQ12 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NinlQ6ZQ12 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
NinlQ6ZQ12 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
NinlQ6ZQ12 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NinlQ6ZQ12 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NinlQ6ZQ12 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NinlQ6ZQ12 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NinlQ6ZQ12 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NinlQ6ZQ12 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NinlQ6ZQ12 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NinlQ6ZQ12 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NinlQ6ZQ12 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NinlQ6ZQ12 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NinlQ6ZQ12 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NinlQ6ZQ12 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NinlQ6ZQ12 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NinlQ6ZQ12 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NinlQ6ZQ12 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NinlQ6ZQ12 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NinlQ6ZQ12 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NinlQ6ZQ12 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NinlQ6ZQ12 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NinlQ6ZQ12 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NinlQ6ZQ12 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NinlQ6ZQ12 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NinlQ6ZQ12 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NinlQ6ZQ12 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NinlQ6ZQ12 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NinlQ6ZQ12 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NinlQ6ZQ12 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NinlQ6ZQ12 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NinlQ6ZQ12 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NinlQ6ZQ12 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NinlQ6ZQ12 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NinlQ6ZQ12 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NinlQ6ZQ12 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NinlQ6ZQ12 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NinlQ6ZQ12 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NinlQ6ZQ12 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NinlQ6ZQ12 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NinlQ6ZQ12 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NinlQ6ZQ12 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NinlQ6ZQ12 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms