Protein–RNA interactions for Protein: Q6W5C0

Cxcl3, C-X-C motif chemokine 3, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl3Q6W5C0 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms