Protein–RNA interactions for Protein: Q6U7R4

Timd4, T-cell immunoglobulin and mucin domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timd4Q6U7R4 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Timd4Q6U7R4 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Timd4Q6U7R4 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Timd4Q6U7R4 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Timd4Q6U7R4 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Timd4Q6U7R4 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Timd4Q6U7R4 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Timd4Q6U7R4 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Timd4Q6U7R4 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Timd4Q6U7R4 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Timd4Q6U7R4 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Timd4Q6U7R4 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Timd4Q6U7R4 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Timd4Q6U7R4 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Timd4Q6U7R4 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Timd4Q6U7R4 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Timd4Q6U7R4 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Timd4Q6U7R4 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Timd4Q6U7R4 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Timd4Q6U7R4 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Timd4Q6U7R4 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Timd4Q6U7R4 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Timd4Q6U7R4 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Timd4Q6U7R4 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Timd4Q6U7R4 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Timd4Q6U7R4 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Timd4Q6U7R4 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Timd4Q6U7R4 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Timd4Q6U7R4 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Timd4Q6U7R4 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Timd4Q6U7R4 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Timd4Q6U7R4 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Timd4Q6U7R4 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Timd4Q6U7R4 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Timd4Q6U7R4 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Timd4Q6U7R4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Timd4Q6U7R4 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Timd4Q6U7R4 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Timd4Q6U7R4 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Timd4Q6U7R4 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Timd4Q6U7R4 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Timd4Q6U7R4 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Timd4Q6U7R4 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Timd4Q6U7R4 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Timd4Q6U7R4 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Timd4Q6U7R4 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Timd4Q6U7R4 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Timd4Q6U7R4 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Timd4Q6U7R4 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Timd4Q6U7R4 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Timd4Q6U7R4 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Timd4Q6U7R4 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Timd4Q6U7R4 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Timd4Q6U7R4 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Timd4Q6U7R4 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Timd4Q6U7R4 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Timd4Q6U7R4 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Timd4Q6U7R4 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Timd4Q6U7R4 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Timd4Q6U7R4 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Timd4Q6U7R4 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Timd4Q6U7R4 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Timd4Q6U7R4 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Timd4Q6U7R4 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Timd4Q6U7R4 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Timd4Q6U7R4 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Timd4Q6U7R4 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Timd4Q6U7R4 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Timd4Q6U7R4 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Timd4Q6U7R4 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms