Protein–RNA interactions for Protein: Q6SJQ5

Cd300ld3, CMRF35-like molecule 3, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300ld3Q6SJQ5 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd300ld3Q6SJQ5 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd300ld3Q6SJQ5 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd300ld3Q6SJQ5 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd300ld3Q6SJQ5 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd300ld3Q6SJQ5 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd300ld3Q6SJQ5 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd300ld3Q6SJQ5 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd300ld3Q6SJQ5 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd300ld3Q6SJQ5 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd300ld3Q6SJQ5 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd300ld3Q6SJQ5 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd300ld3Q6SJQ5 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd300ld3Q6SJQ5 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd300ld3Q6SJQ5 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd300ld3Q6SJQ5 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd300ld3Q6SJQ5 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd300ld3Q6SJQ5 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd300ld3Q6SJQ5 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd300ld3Q6SJQ5 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd300ld3Q6SJQ5 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd300ld3Q6SJQ5 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd300ld3Q6SJQ5 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd300ld3Q6SJQ5 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd300ld3Q6SJQ5 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd300ld3Q6SJQ5 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd300ld3Q6SJQ5 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd300ld3Q6SJQ5 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd300ld3Q6SJQ5 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd300ld3Q6SJQ5 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd300ld3Q6SJQ5 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd300ld3Q6SJQ5 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd300ld3Q6SJQ5 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd300ld3Q6SJQ5 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd300ld3Q6SJQ5 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd300ld3Q6SJQ5 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd300ld3Q6SJQ5 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd300ld3Q6SJQ5 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd300ld3Q6SJQ5 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd300ld3Q6SJQ5 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd300ld3Q6SJQ5 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd300ld3Q6SJQ5 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd300ld3Q6SJQ5 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd300ld3Q6SJQ5 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd300ld3Q6SJQ5 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd300ld3Q6SJQ5 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd300ld3Q6SJQ5 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd300ld3Q6SJQ5 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd300ld3Q6SJQ5 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd300ld3Q6SJQ5 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd300ld3Q6SJQ5 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd300ld3Q6SJQ5 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd300ld3Q6SJQ5 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd300ld3Q6SJQ5 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd300ld3Q6SJQ5 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd300ld3Q6SJQ5 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd300ld3Q6SJQ5 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cd300ld3Q6SJQ5 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd300ld3Q6SJQ5 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cd300ld3Q6SJQ5 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd300ld3Q6SJQ5 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd300ld3Q6SJQ5 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd300ld3Q6SJQ5 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cd300ld3Q6SJQ5 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cd300ld3Q6SJQ5 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd300ld3Q6SJQ5 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd300ld3Q6SJQ5 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd300ld3Q6SJQ5 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd300ld3Q6SJQ5 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd300ld3Q6SJQ5 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd300ld3Q6SJQ5 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd300ld3Q6SJQ5 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd300ld3Q6SJQ5 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd300ld3Q6SJQ5 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd300ld3Q6SJQ5 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd300ld3Q6SJQ5 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd300ld3Q6SJQ5 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd300ld3Q6SJQ5 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd300ld3Q6SJQ5 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd300ld3Q6SJQ5 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd300ld3Q6SJQ5 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd300ld3Q6SJQ5 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd300ld3Q6SJQ5 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd300ld3Q6SJQ5 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd300ld3Q6SJQ5 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd300ld3Q6SJQ5 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd300ld3Q6SJQ5 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd300ld3Q6SJQ5 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd300ld3Q6SJQ5 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd300ld3Q6SJQ5 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd300ld3Q6SJQ5 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd300ld3Q6SJQ5 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms