Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5L9

Shc4, SHC-transforming protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc4Q6S5L9 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shc4Q6S5L9 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shc4Q6S5L9 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shc4Q6S5L9 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shc4Q6S5L9 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shc4Q6S5L9 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shc4Q6S5L9 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shc4Q6S5L9 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Shc4Q6S5L9 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Shc4Q6S5L9 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shc4Q6S5L9 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shc4Q6S5L9 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shc4Q6S5L9 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shc4Q6S5L9 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shc4Q6S5L9 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shc4Q6S5L9 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shc4Q6S5L9 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shc4Q6S5L9 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Shc4Q6S5L9 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shc4Q6S5L9 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shc4Q6S5L9 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shc4Q6S5L9 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shc4Q6S5L9 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shc4Q6S5L9 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shc4Q6S5L9 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shc4Q6S5L9 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shc4Q6S5L9 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shc4Q6S5L9 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shc4Q6S5L9 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shc4Q6S5L9 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shc4Q6S5L9 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shc4Q6S5L9 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shc4Q6S5L9 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shc4Q6S5L9 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shc4Q6S5L9 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shc4Q6S5L9 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shc4Q6S5L9 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shc4Q6S5L9 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shc4Q6S5L9 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shc4Q6S5L9 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shc4Q6S5L9 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shc4Q6S5L9 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shc4Q6S5L9 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shc4Q6S5L9 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shc4Q6S5L9 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shc4Q6S5L9 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shc4Q6S5L9 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shc4Q6S5L9 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shc4Q6S5L9 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shc4Q6S5L9 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shc4Q6S5L9 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shc4Q6S5L9 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shc4Q6S5L9 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shc4Q6S5L9 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Shc4Q6S5L9 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shc4Q6S5L9 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shc4Q6S5L9 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shc4Q6S5L9 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shc4Q6S5L9 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shc4Q6S5L9 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shc4Q6S5L9 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shc4Q6S5L9 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shc4Q6S5L9 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shc4Q6S5L9 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shc4Q6S5L9 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Shc4Q6S5L9 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shc4Q6S5L9 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shc4Q6S5L9 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms