Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH4

Gcsam, Germinal center-associated signaling and motility protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GcsamQ6RFH4 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GcsamQ6RFH4 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GcsamQ6RFH4 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GcsamQ6RFH4 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GcsamQ6RFH4 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GcsamQ6RFH4 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GcsamQ6RFH4 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GcsamQ6RFH4 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GcsamQ6RFH4 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GcsamQ6RFH4 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GcsamQ6RFH4 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GcsamQ6RFH4 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GcsamQ6RFH4 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GcsamQ6RFH4 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GcsamQ6RFH4 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GcsamQ6RFH4 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GcsamQ6RFH4 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GcsamQ6RFH4 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GcsamQ6RFH4 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GcsamQ6RFH4 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GcsamQ6RFH4 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GcsamQ6RFH4 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GcsamQ6RFH4 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GcsamQ6RFH4 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GcsamQ6RFH4 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GcsamQ6RFH4 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GcsamQ6RFH4 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GcsamQ6RFH4 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GcsamQ6RFH4 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GcsamQ6RFH4 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GcsamQ6RFH4 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GcsamQ6RFH4 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GcsamQ6RFH4 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GcsamQ6RFH4 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GcsamQ6RFH4 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GcsamQ6RFH4 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GcsamQ6RFH4 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GcsamQ6RFH4 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GcsamQ6RFH4 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GcsamQ6RFH4 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GcsamQ6RFH4 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GcsamQ6RFH4 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GcsamQ6RFH4 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GcsamQ6RFH4 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GcsamQ6RFH4 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GcsamQ6RFH4 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GcsamQ6RFH4 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GcsamQ6RFH4 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GcsamQ6RFH4 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GcsamQ6RFH4 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GcsamQ6RFH4 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GcsamQ6RFH4 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GcsamQ6RFH4 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GcsamQ6RFH4 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GcsamQ6RFH4 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GcsamQ6RFH4 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GcsamQ6RFH4 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GcsamQ6RFH4 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GcsamQ6RFH4 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GcsamQ6RFH4 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GcsamQ6RFH4 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GcsamQ6RFH4 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GcsamQ6RFH4 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GcsamQ6RFH4 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GcsamQ6RFH4 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GcsamQ6RFH4 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GcsamQ6RFH4 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GcsamQ6RFH4 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GcsamQ6RFH4 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GcsamQ6RFH4 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GcsamQ6RFH4 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GcsamQ6RFH4 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GcsamQ6RFH4 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GcsamQ6RFH4 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GcsamQ6RFH4 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GcsamQ6RFH4 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GcsamQ6RFH4 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GcsamQ6RFH4 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GcsamQ6RFH4 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GcsamQ6RFH4 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GcsamQ6RFH4 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GcsamQ6RFH4 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GcsamQ6RFH4 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GcsamQ6RFH4 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GcsamQ6RFH4 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GcsamQ6RFH4 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GcsamQ6RFH4 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GcsamQ6RFH4 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GcsamQ6RFH4 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GcsamQ6RFH4 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GcsamQ6RFH4 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GcsamQ6RFH4 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GcsamQ6RFH4 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GcsamQ6RFH4 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GcsamQ6RFH4 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GcsamQ6RFH4 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GcsamQ6RFH4 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GcsamQ6RFH4 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GcsamQ6RFH4 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GcsamQ6RFH4 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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