Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG04

Ccdc82, Coiled-coil domain-containing protein 82, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc82Q6PG04 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc82Q6PG04 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc82Q6PG04 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc82Q6PG04 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc82Q6PG04 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc82Q6PG04 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc82Q6PG04 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc82Q6PG04 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc82Q6PG04 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc82Q6PG04 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc82Q6PG04 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc82Q6PG04 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc82Q6PG04 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc82Q6PG04 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc82Q6PG04 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc82Q6PG04 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc82Q6PG04 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc82Q6PG04 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc82Q6PG04 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc82Q6PG04 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc82Q6PG04 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc82Q6PG04 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc82Q6PG04 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc82Q6PG04 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc82Q6PG04 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc82Q6PG04 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc82Q6PG04 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc82Q6PG04 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc82Q6PG04 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc82Q6PG04 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc82Q6PG04 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc82Q6PG04 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc82Q6PG04 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc82Q6PG04 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc82Q6PG04 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc82Q6PG04 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc82Q6PG04 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc82Q6PG04 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc82Q6PG04 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc82Q6PG04 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc82Q6PG04 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc82Q6PG04 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc82Q6PG04 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc82Q6PG04 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc82Q6PG04 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc82Q6PG04 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc82Q6PG04 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc82Q6PG04 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc82Q6PG04 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc82Q6PG04 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc82Q6PG04 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc82Q6PG04 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc82Q6PG04 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc82Q6PG04 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc82Q6PG04 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc82Q6PG04 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc82Q6PG04 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc82Q6PG04 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc82Q6PG04 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc82Q6PG04 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc82Q6PG04 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc82Q6PG04 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc82Q6PG04 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc82Q6PG04 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc82Q6PG04 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc82Q6PG04 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc82Q6PG04 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc82Q6PG04 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc82Q6PG04 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc82Q6PG04 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc82Q6PG04 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc82Q6PG04 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc82Q6PG04 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc82Q6PG04 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc82Q6PG04 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc82Q6PG04 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc82Q6PG04 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc82Q6PG04 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc82Q6PG04 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc82Q6PG04 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc82Q6PG04 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc82Q6PG04 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc82Q6PG04 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc82Q6PG04 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc82Q6PG04 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc82Q6PG04 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc82Q6PG04 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc82Q6PG04 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc82Q6PG04 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc82Q6PG04 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc82Q6PG04 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc82Q6PG04 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc82Q6PG04 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc82Q6PG04 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc82Q6PG04 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc82Q6PG04 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc82Q6PG04 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc82Q6PG04 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc82Q6PG04 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc82Q6PG04 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms