Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFF0

Scaf4, SR-related CTD-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf4Q6PFF0 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scaf4Q6PFF0 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scaf4Q6PFF0 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scaf4Q6PFF0 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scaf4Q6PFF0 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scaf4Q6PFF0 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scaf4Q6PFF0 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scaf4Q6PFF0 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scaf4Q6PFF0 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scaf4Q6PFF0 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scaf4Q6PFF0 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scaf4Q6PFF0 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Scaf4Q6PFF0 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scaf4Q6PFF0 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scaf4Q6PFF0 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scaf4Q6PFF0 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scaf4Q6PFF0 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scaf4Q6PFF0 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scaf4Q6PFF0 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Scaf4Q6PFF0 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scaf4Q6PFF0 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Scaf4Q6PFF0 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Scaf4Q6PFF0 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scaf4Q6PFF0 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scaf4Q6PFF0 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scaf4Q6PFF0 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scaf4Q6PFF0 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scaf4Q6PFF0 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scaf4Q6PFF0 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scaf4Q6PFF0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scaf4Q6PFF0 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scaf4Q6PFF0 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scaf4Q6PFF0 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scaf4Q6PFF0 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scaf4Q6PFF0 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scaf4Q6PFF0 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scaf4Q6PFF0 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scaf4Q6PFF0 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scaf4Q6PFF0 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scaf4Q6PFF0 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scaf4Q6PFF0 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scaf4Q6PFF0 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scaf4Q6PFF0 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scaf4Q6PFF0 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scaf4Q6PFF0 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scaf4Q6PFF0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scaf4Q6PFF0 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scaf4Q6PFF0 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scaf4Q6PFF0 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scaf4Q6PFF0 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scaf4Q6PFF0 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scaf4Q6PFF0 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scaf4Q6PFF0 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scaf4Q6PFF0 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scaf4Q6PFF0 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scaf4Q6PFF0 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scaf4Q6PFF0 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scaf4Q6PFF0 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scaf4Q6PFF0 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scaf4Q6PFF0 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scaf4Q6PFF0 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scaf4Q6PFF0 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scaf4Q6PFF0 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scaf4Q6PFF0 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scaf4Q6PFF0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scaf4Q6PFF0 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scaf4Q6PFF0 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scaf4Q6PFF0 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scaf4Q6PFF0 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scaf4Q6PFF0 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scaf4Q6PFF0 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scaf4Q6PFF0 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scaf4Q6PFF0 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scaf4Q6PFF0 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scaf4Q6PFF0 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scaf4Q6PFF0 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scaf4Q6PFF0 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scaf4Q6PFF0 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scaf4Q6PFF0 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scaf4Q6PFF0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scaf4Q6PFF0 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scaf4Q6PFF0 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Scaf4Q6PFF0 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scaf4Q6PFF0 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scaf4Q6PFF0 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scaf4Q6PFF0 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scaf4Q6PFF0 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scaf4Q6PFF0 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scaf4Q6PFF0 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scaf4Q6PFF0 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scaf4Q6PFF0 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scaf4Q6PFF0 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scaf4Q6PFF0 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scaf4Q6PFF0 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scaf4Q6PFF0 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scaf4Q6PFF0 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scaf4Q6PFF0 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scaf4Q6PFF0 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scaf4Q6PFF0 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scaf4Q6PFF0 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms