Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmeff1Q6PFE7 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmeff1Q6PFE7 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmeff1Q6PFE7 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmeff1Q6PFE7 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmeff1Q6PFE7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmeff1Q6PFE7 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmeff1Q6PFE7 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Tmeff1Q6PFE7 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Tmeff1Q6PFE7 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmeff1Q6PFE7 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmeff1Q6PFE7 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Tmeff1Q6PFE7 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
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Tmeff1Q6PFE7 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmeff1Q6PFE7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmeff1Q6PFE7 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Tmeff1Q6PFE7 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
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Tmeff1Q6PFE7 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Tmeff1Q6PFE7 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Tmeff1Q6PFE7 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Tmeff1Q6PFE7 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmeff1Q6PFE7 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmeff1Q6PFE7 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmeff1Q6PFE7 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmeff1Q6PFE7 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmeff1Q6PFE7 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmeff1Q6PFE7 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Tmeff1Q6PFE7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmeff1Q6PFE7 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Tmeff1Q6PFE7 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmeff1Q6PFE7 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmeff1Q6PFE7 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Tmeff1Q6PFE7 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmeff1Q6PFE7 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Tmeff1Q6PFE7 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmeff1Q6PFE7 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmeff1Q6PFE7 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmeff1Q6PFE7 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmeff1Q6PFE7 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmeff1Q6PFE7 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Tmeff1Q6PFE7 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Tmeff1Q6PFE7 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmeff1Q6PFE7 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmeff1Q6PFE7 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Tmeff1Q6PFE7 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmeff1Q6PFE7 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmeff1Q6PFE7 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmeff1Q6PFE7 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmeff1Q6PFE7 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmeff1Q6PFE7 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmeff1Q6PFE7 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmeff1Q6PFE7 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmeff1Q6PFE7 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmeff1Q6PFE7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Tmeff1Q6PFE7 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmeff1Q6PFE7 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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