Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEM8

Slc46a1, Proton-coupled folate transporter, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc46a1Q6PEM8 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc46a1Q6PEM8 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc46a1Q6PEM8 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc46a1Q6PEM8 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc46a1Q6PEM8 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc46a1Q6PEM8 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc46a1Q6PEM8 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc46a1Q6PEM8 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc46a1Q6PEM8 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc46a1Q6PEM8 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc46a1Q6PEM8 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc46a1Q6PEM8 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc46a1Q6PEM8 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc46a1Q6PEM8 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc46a1Q6PEM8 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc46a1Q6PEM8 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc46a1Q6PEM8 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc46a1Q6PEM8 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc46a1Q6PEM8 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc46a1Q6PEM8 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc46a1Q6PEM8 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc46a1Q6PEM8 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc46a1Q6PEM8 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc46a1Q6PEM8 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc46a1Q6PEM8 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc46a1Q6PEM8 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc46a1Q6PEM8 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc46a1Q6PEM8 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc46a1Q6PEM8 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc46a1Q6PEM8 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc46a1Q6PEM8 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc46a1Q6PEM8 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc46a1Q6PEM8 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc46a1Q6PEM8 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Slc46a1Q6PEM8 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc46a1Q6PEM8 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc46a1Q6PEM8 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc46a1Q6PEM8 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc46a1Q6PEM8 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc46a1Q6PEM8 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc46a1Q6PEM8 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc46a1Q6PEM8 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc46a1Q6PEM8 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc46a1Q6PEM8 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc46a1Q6PEM8 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc46a1Q6PEM8 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc46a1Q6PEM8 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc46a1Q6PEM8 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc46a1Q6PEM8 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc46a1Q6PEM8 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Slc46a1Q6PEM8 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc46a1Q6PEM8 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc46a1Q6PEM8 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc46a1Q6PEM8 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc46a1Q6PEM8 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc46a1Q6PEM8 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc46a1Q6PEM8 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc46a1Q6PEM8 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc46a1Q6PEM8 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Slc46a1Q6PEM8 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc46a1Q6PEM8 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc46a1Q6PEM8 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc46a1Q6PEM8 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc46a1Q6PEM8 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc46a1Q6PEM8 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc46a1Q6PEM8 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc46a1Q6PEM8 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc46a1Q6PEM8 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc46a1Q6PEM8 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc46a1Q6PEM8 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc46a1Q6PEM8 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Slc46a1Q6PEM8 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc46a1Q6PEM8 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc46a1Q6PEM8 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Slc46a1Q6PEM8 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc46a1Q6PEM8 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc46a1Q6PEM8 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc46a1Q6PEM8 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc46a1Q6PEM8 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc46a1Q6PEM8 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc46a1Q6PEM8 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Slc46a1Q6PEM8 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc46a1Q6PEM8 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc46a1Q6PEM8 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc46a1Q6PEM8 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Slc46a1Q6PEM8 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc46a1Q6PEM8 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc46a1Q6PEM8 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Slc46a1Q6PEM8 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Slc46a1Q6PEM8 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc46a1Q6PEM8 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Slc46a1Q6PEM8 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc46a1Q6PEM8 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Slc46a1Q6PEM8 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc46a1Q6PEM8 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc46a1Q6PEM8 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc46a1Q6PEM8 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Slc46a1Q6PEM8 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Slc46a1Q6PEM8 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Slc46a1Q6PEM8 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms