Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDY0

Ccdc85b, Coiled-coil domain-containing protein 85B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85bQ6PDY0 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc85bQ6PDY0 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc85bQ6PDY0 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc85bQ6PDY0 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc85bQ6PDY0 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc85bQ6PDY0 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc85bQ6PDY0 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc85bQ6PDY0 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc85bQ6PDY0 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc85bQ6PDY0 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc85bQ6PDY0 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc85bQ6PDY0 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc85bQ6PDY0 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc85bQ6PDY0 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc85bQ6PDY0 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc85bQ6PDY0 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc85bQ6PDY0 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc85bQ6PDY0 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc85bQ6PDY0 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc85bQ6PDY0 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc85bQ6PDY0 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc85bQ6PDY0 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc85bQ6PDY0 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc85bQ6PDY0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc85bQ6PDY0 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc85bQ6PDY0 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc85bQ6PDY0 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc85bQ6PDY0 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc85bQ6PDY0 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc85bQ6PDY0 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc85bQ6PDY0 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc85bQ6PDY0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc85bQ6PDY0 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc85bQ6PDY0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc85bQ6PDY0 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc85bQ6PDY0 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc85bQ6PDY0 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc85bQ6PDY0 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc85bQ6PDY0 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc85bQ6PDY0 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc85bQ6PDY0 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc85bQ6PDY0 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc85bQ6PDY0 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc85bQ6PDY0 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc85bQ6PDY0 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc85bQ6PDY0 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc85bQ6PDY0 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc85bQ6PDY0 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc85bQ6PDY0 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc85bQ6PDY0 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc85bQ6PDY0 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc85bQ6PDY0 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc85bQ6PDY0 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc85bQ6PDY0 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc85bQ6PDY0 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc85bQ6PDY0 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc85bQ6PDY0 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc85bQ6PDY0 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc85bQ6PDY0 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc85bQ6PDY0 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc85bQ6PDY0 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc85bQ6PDY0 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc85bQ6PDY0 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc85bQ6PDY0 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc85bQ6PDY0 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc85bQ6PDY0 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc85bQ6PDY0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc85bQ6PDY0 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc85bQ6PDY0 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc85bQ6PDY0 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc85bQ6PDY0 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc85bQ6PDY0 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc85bQ6PDY0 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc85bQ6PDY0 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc85bQ6PDY0 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc85bQ6PDY0 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc85bQ6PDY0 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc85bQ6PDY0 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc85bQ6PDY0 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc85bQ6PDY0 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc85bQ6PDY0 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc85bQ6PDY0 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc85bQ6PDY0 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc85bQ6PDY0 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc85bQ6PDY0 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc85bQ6PDY0 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc85bQ6PDY0 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc85bQ6PDY0 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc85bQ6PDY0 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc85bQ6PDY0 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc85bQ6PDY0 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc85bQ6PDY0 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc85bQ6PDY0 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc85bQ6PDY0 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc85bQ6PDY0 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc85bQ6PDY0 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc85bQ6PDY0 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms